Protein–RNA interactions for Protein: Q3TZ89

Sec31b, Protein transport protein Sec31B, mousemouse

Predictions only

Length 1,158 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec31bQ3TZ89 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
Sec31bQ3TZ89 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Sec31bQ3TZ89 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Sec31bQ3TZ89 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Sec31bQ3TZ89 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Sec31bQ3TZ89 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Sec31bQ3TZ89 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Sec31bQ3TZ89 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Sec31bQ3TZ89 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Sec31bQ3TZ89 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Sec31bQ3TZ89 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Sec31bQ3TZ89 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Sec31bQ3TZ89 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Sec31bQ3TZ89 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Sec31bQ3TZ89 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Sec31bQ3TZ89 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Sec31bQ3TZ89 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Sec31bQ3TZ89 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
Sec31bQ3TZ89 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Sec31bQ3TZ89 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
Sec31bQ3TZ89 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
Sec31bQ3TZ89 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Sec31bQ3TZ89 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Sec31bQ3TZ89 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Sec31bQ3TZ89 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Sec31bQ3TZ89 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Sec31bQ3TZ89 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
Sec31bQ3TZ89 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Sec31bQ3TZ89 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
Sec31bQ3TZ89 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Sec31bQ3TZ89 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Sec31bQ3TZ89 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Sec31bQ3TZ89 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Sec31bQ3TZ89 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Sec31bQ3TZ89 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Sec31bQ3TZ89 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Sec31bQ3TZ89 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Sec31bQ3TZ89 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Sec31bQ3TZ89 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Sec31bQ3TZ89 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Sec31bQ3TZ89 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Sec31bQ3TZ89 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Sec31bQ3TZ89 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Sec31bQ3TZ89 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
Sec31bQ3TZ89 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Sec31bQ3TZ89 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Sec31bQ3TZ89 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Sec31bQ3TZ89 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Sec31bQ3TZ89 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Sec31bQ3TZ89 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Sec31bQ3TZ89 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Sec31bQ3TZ89 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Sec31bQ3TZ89 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Sec31bQ3TZ89 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Sec31bQ3TZ89 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Sec31bQ3TZ89 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Sec31bQ3TZ89 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Sec31bQ3TZ89 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Sec31bQ3TZ89 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Sec31bQ3TZ89 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Sec31bQ3TZ89 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Sec31bQ3TZ89 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
Sec31bQ3TZ89 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
Sec31bQ3TZ89 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Sec31bQ3TZ89 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Sec31bQ3TZ89 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Sec31bQ3TZ89 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Sec31bQ3TZ89 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Sec31bQ3TZ89 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Sec31bQ3TZ89 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Sec31bQ3TZ89 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Sec31bQ3TZ89 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Sec31bQ3TZ89 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
Sec31bQ3TZ89 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Sec31bQ3TZ89 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Sec31bQ3TZ89 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Sec31bQ3TZ89 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Sec31bQ3TZ89 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Sec31bQ3TZ89 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Sec31bQ3TZ89 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Sec31bQ3TZ89 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Sec31bQ3TZ89 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Sec31bQ3TZ89 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Sec31bQ3TZ89 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
Sec31bQ3TZ89 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Sec31bQ3TZ89 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Sec31bQ3TZ89 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Sec31bQ3TZ89 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Sec31bQ3TZ89 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Sec31bQ3TZ89 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Sec31bQ3TZ89 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Sec31bQ3TZ89 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Sec31bQ3TZ89 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Sec31bQ3TZ89 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Sec31bQ3TZ89 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
Sec31bQ3TZ89 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Sec31bQ3TZ89 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Sec31bQ3TZ89 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Sec31bQ3TZ89 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
Sec31bQ3TZ89 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.2 ms