Protein–RNA interactions for Protein: Q3TQ88

Ceacam19, Carcinoembryonic antigen-related cell adhesion molecule 19, mousemouse

Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ceacam19Q3TQ88 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ceacam19Q3TQ88 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ceacam19Q3TQ88 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ceacam19Q3TQ88 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ceacam19Q3TQ88 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ceacam19Q3TQ88 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ceacam19Q3TQ88 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ceacam19Q3TQ88 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ceacam19Q3TQ88 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ceacam19Q3TQ88 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ceacam19Q3TQ88 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ceacam19Q3TQ88 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ceacam19Q3TQ88 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ceacam19Q3TQ88 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ceacam19Q3TQ88 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ceacam19Q3TQ88 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ceacam19Q3TQ88 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Ceacam19Q3TQ88 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ceacam19Q3TQ88 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Ceacam19Q3TQ88 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Ceacam19Q3TQ88 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ceacam19Q3TQ88 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ceacam19Q3TQ88 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ceacam19Q3TQ88 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ceacam19Q3TQ88 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ceacam19Q3TQ88 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ceacam19Q3TQ88 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ceacam19Q3TQ88 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ceacam19Q3TQ88 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ceacam19Q3TQ88 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ceacam19Q3TQ88 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ceacam19Q3TQ88 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ceacam19Q3TQ88 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ceacam19Q3TQ88 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ceacam19Q3TQ88 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ceacam19Q3TQ88 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
Ceacam19Q3TQ88 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ceacam19Q3TQ88 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ceacam19Q3TQ88 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ceacam19Q3TQ88 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ceacam19Q3TQ88 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ceacam19Q3TQ88 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ceacam19Q3TQ88 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ceacam19Q3TQ88 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ceacam19Q3TQ88 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ceacam19Q3TQ88 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ceacam19Q3TQ88 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Ceacam19Q3TQ88 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ceacam19Q3TQ88 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ceacam19Q3TQ88 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ceacam19Q3TQ88 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ceacam19Q3TQ88 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ceacam19Q3TQ88 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ceacam19Q3TQ88 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ceacam19Q3TQ88 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ceacam19Q3TQ88 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ceacam19Q3TQ88 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ceacam19Q3TQ88 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Ceacam19Q3TQ88 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ceacam19Q3TQ88 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ceacam19Q3TQ88 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ceacam19Q3TQ88 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ceacam19Q3TQ88 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ceacam19Q3TQ88 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ceacam19Q3TQ88 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ceacam19Q3TQ88 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ceacam19Q3TQ88 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ceacam19Q3TQ88 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ceacam19Q3TQ88 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ceacam19Q3TQ88 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ceacam19Q3TQ88 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ceacam19Q3TQ88 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ceacam19Q3TQ88 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ceacam19Q3TQ88 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ceacam19Q3TQ88 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ceacam19Q3TQ88 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ceacam19Q3TQ88 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ceacam19Q3TQ88 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ceacam19Q3TQ88 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ceacam19Q3TQ88 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ceacam19Q3TQ88 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ceacam19Q3TQ88 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ceacam19Q3TQ88 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ceacam19Q3TQ88 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ceacam19Q3TQ88 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ceacam19Q3TQ88 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ceacam19Q3TQ88 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ceacam19Q3TQ88 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ceacam19Q3TQ88 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ceacam19Q3TQ88 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ceacam19Q3TQ88 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ceacam19Q3TQ88 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Ceacam19Q3TQ88 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ceacam19Q3TQ88 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ceacam19Q3TQ88 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ceacam19Q3TQ88 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Ceacam19Q3TQ88 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ceacam19Q3TQ88 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ceacam19Q3TQ88 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ceacam19Q3TQ88 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.1 ms