Protein–RNA interactions for Protein: Q14AI6

Rpusd3, Mitochondrial mRNA pseudouridine synthase Rpusd3, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd3Q14AI6 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Rpusd3Q14AI6 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Rpusd3Q14AI6 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rpusd3Q14AI6 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rpusd3Q14AI6 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rpusd3Q14AI6 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rpusd3Q14AI6 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rpusd3Q14AI6 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rpusd3Q14AI6 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rpusd3Q14AI6 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rpusd3Q14AI6 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rpusd3Q14AI6 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rpusd3Q14AI6 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Rpusd3Q14AI6 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rpusd3Q14AI6 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rpusd3Q14AI6 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rpusd3Q14AI6 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rpusd3Q14AI6 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Rpusd3Q14AI6 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rpusd3Q14AI6 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rpusd3Q14AI6 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rpusd3Q14AI6 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Rpusd3Q14AI6 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rpusd3Q14AI6 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rpusd3Q14AI6 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rpusd3Q14AI6 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rpusd3Q14AI6 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rpusd3Q14AI6 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rpusd3Q14AI6 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Rpusd3Q14AI6 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Rpusd3Q14AI6 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rpusd3Q14AI6 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rpusd3Q14AI6 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Rpusd3Q14AI6 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rpusd3Q14AI6 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Rpusd3Q14AI6 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rpusd3Q14AI6 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rpusd3Q14AI6 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rpusd3Q14AI6 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rpusd3Q14AI6 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rpusd3Q14AI6 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rpusd3Q14AI6 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rpusd3Q14AI6 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rpusd3Q14AI6 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rpusd3Q14AI6 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rpusd3Q14AI6 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rpusd3Q14AI6 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rpusd3Q14AI6 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rpusd3Q14AI6 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rpusd3Q14AI6 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rpusd3Q14AI6 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Rpusd3Q14AI6 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Rpusd3Q14AI6 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Rpusd3Q14AI6 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rpusd3Q14AI6 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rpusd3Q14AI6 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rpusd3Q14AI6 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rpusd3Q14AI6 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rpusd3Q14AI6 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rpusd3Q14AI6 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rpusd3Q14AI6 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Rpusd3Q14AI6 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Rpusd3Q14AI6 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Rpusd3Q14AI6 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Rpusd3Q14AI6 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Rpusd3Q14AI6 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Rpusd3Q14AI6 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rpusd3Q14AI6 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rpusd3Q14AI6 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rpusd3Q14AI6 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rpusd3Q14AI6 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rpusd3Q14AI6 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Rpusd3Q14AI6 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rpusd3Q14AI6 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rpusd3Q14AI6 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rpusd3Q14AI6 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Rpusd3Q14AI6 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rpusd3Q14AI6 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Rpusd3Q14AI6 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Rpusd3Q14AI6 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Rpusd3Q14AI6 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Rpusd3Q14AI6 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Rpusd3Q14AI6 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Rpusd3Q14AI6 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Rpusd3Q14AI6 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Rpusd3Q14AI6 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Rpusd3Q14AI6 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Rpusd3Q14AI6 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Rpusd3Q14AI6 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Rpusd3Q14AI6 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Rpusd3Q14AI6 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Rpusd3Q14AI6 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Rpusd3Q14AI6 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rpusd3Q14AI6 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rpusd3Q14AI6 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Rpusd3Q14AI6 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rpusd3Q14AI6 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rpusd3Q14AI6 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rpusd3Q14AI6 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rpusd3Q14AI6 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
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