Protein–RNA interactions for Protein: Q12468

RRI1, COP9 signalosome complex subunit 5, yeastyeast

Predictions only

Length 440 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
RRI1Q12468 GAL1YBR020W 1587 nt9.67□□□□□ -0.86
RRI1Q12468 YLR179CYLR179C 606 nt9.67□□□□□ -0.86
RRI1Q12468 DDR2YOL052C-A 186 nt9.67□□□□□ -0.86
RRI1Q12468 HEM12YDR047W 1089 nt9.65□□□□□ -0.86
RRI1Q12468 TRM5YHR070W 1500 nt9.64□□□□□ -0.87
RRI1Q12468 ATF2YGR177C 1608 nt9.64□□□□□ -0.87
RRI1Q12468 MRPL8YJL063C 717 nt9.63□□□□□ -0.87
RRI1Q12468 RTG1YOL067C 534 nt9.62□□□□□ -0.87
RRI1Q12468 YPR064WYPR064W 420 nt9.61□□□□□ -0.87
RRI1Q12468 YDL086C-AYDL086C-A 435 nt9.59□□□□□ -0.87
RRI1Q12468 YEL076C-AYEL076C-A 651 nt9.59□□□□□ -0.87
RRI1Q12468 YEL076CYEL076C 651 nt9.59□□□□□ -0.87
RRI1Q12468 ADO1YJR105W 1023 nt9.59□□□□□ -0.87
RRI1Q12468 YLR464WYLR464W 651 nt9.59□□□□□ -0.87
RRI1Q12468 SNG1YGR197C 1644 nt9.57□□□□□ -0.88
RRI1Q12468 HUA1YGR268C 597 nt9.57□□□□□ -0.88
RRI1Q12468 STB1YNL309W 1263 nt9.57□□□□□ -0.88
RRI1Q12468 GPI16YHR188C 1833 nt9.56□□□□□ -0.88
RRI1Q12468 FUR4YBR021W 1902 nt9.56□□□□□ -0.88
RRI1Q12468 SPC25YER018C 666 nt9.56□□□□□ -0.88
RRI1Q12468 YHR056W-AYHR056W-A 435 nt9.56□□□□□ -0.88
RRI1Q12468 YDR524C-BYDR524C-B 201 nt9.55□□□□□ -0.88
RRI1Q12468 AHT1YHR093W 549 nt9.55□□□□□ -0.88
RRI1Q12468 MIC10YCL057C-A 294 nt9.54□□□□□ -0.88
RRI1Q12468 ANP1YEL036C 1503 nt9.53□□□□□ -0.88
RRI1Q12468 RAX1YOR301W 1308 nt9.53□□□□□ -0.88
RRI1Q12468 WSC2YNL283C 1512 nt9.51□□□□□ -0.89
RRI1Q12468 TAD3YLR316C 969 nt9.51□□□□□ -0.89
RRI1Q12468 BNA2YJR078W 1362 nt9.5□□□□□ -0.89
RRI1Q12468 RPM1RPM1 483 nt9.5□□□□□ -0.89
RRI1Q12468 PRP4YPR178W 1398 nt9.5□□□□□ -0.89
RRI1Q12468 AAC1YMR056C 930 nt9.49□□□□□ -0.89
RRI1Q12468 FEN2YCR028C 1539 nt9.49□□□□□ -0.89
RRI1Q12468 CCT4YDL143W 1587 nt9.49□□□□□ -0.89
RRI1Q12468 tL(GAG)GtL(GAG)G 82 nt9.47□□□□□ -0.89
RRI1Q12468 SWC5YBR231C 912 nt9.47□□□□□ -0.89
RRI1Q12468 NAR1YNL240C 1476 nt9.46□□□□□ -0.9
RRI1Q12468 VPS60YDR486C 690 nt9.45□□□□□ -0.9
RRI1Q12468 DPS1YLL018C 1674 nt9.44□□□□□ -0.9
RRI1Q12468 CCA1YER168C 1641 nt9.41□□□□□ -0.9
RRI1Q12468 YIR016WYIR016W 798 nt9.4□□□□□ -0.9
RRI1Q12468 MIC12YBR262C 321 nt9.39□□□□□ -0.91
RRI1Q12468 BMT6YLR063W 1098 nt9.38□□□□□ -0.91
RRI1Q12468 YLR415CYLR415C 339 nt9.37□□□□□ -0.91
RRI1Q12468 ALG3YBL082C 1377 nt9.37□□□□□ -0.91
RRI1Q12468 HHO1YPL127C 777 nt9.35□□□□□ -0.91
RRI1Q12468 YGR201CYGR201C 678 nt9.32□□□□□ -0.92
RRI1Q12468 BIO5YNR056C 1686 nt9.32□□□□□ -0.92
RRI1Q12468 BDH1YAL060W 1149 nt9.31□□□□□ -0.92
RRI1Q12468 YKR005CYKR005C 1578 nt9.31□□□□□ -0.92
RRI1Q12468 PBP1YGR178C 2169 nt9.27□□□□□ -0.92
RRI1Q12468 SNF1YDR477W 1902 nt9.27□□□□□ -0.93
RRI1Q12468 CYT2YKL087C 675 nt9.26□□□□□ -0.93
RRI1Q12468 TIM17YJL143W 477 nt9.25□□□□□ -0.93
RRI1Q12468 XDJ1YLR090W 1380 nt9.24□□□□□ -0.93
RRI1Q12468 YSP3YOR003W 1437 nt9.24□□□□□ -0.93
RRI1Q12468 DUS1YML080W 1272 nt9.22□□□□□ -0.93
RRI1Q12468 PEX25YPL112C 1185 nt9.22□□□□□ -0.93
RRI1Q12468 GDH3YAL062W 1374 nt9.22□□□□□ -0.93
RRI1Q12468 IRC24YIR036C 792 nt9.21□□□□□ -0.94
RRI1Q12468 YGR259CYGR259C 441 nt9.2□□□□□ -0.94
RRI1Q12468 GOR1YNL274C 1053 nt9.2□□□□□ -0.94
RRI1Q12468 YCL074WYCL074W 927 nt9.18□□□□□ -0.94
RRI1Q12468 AVT6YER119C 1347 nt9.18□□□□□ -0.94
RRI1Q12468 YFR018CYFR018C 1092 nt9.18□□□□□ -0.94
RRI1Q12468 CMP2YML057W 1815 nt9.18□□□□□ -0.94
RRI1Q12468 YNL115CYNL115C 1935 nt9.18□□□□□ -0.94
RRI1Q12468 AGP1YCL025C 1902 nt9.17□□□□□ -0.94
RRI1Q12468 SHM2YLR058C 1410 nt9.17□□□□□ -0.94
RRI1Q12468 YDR094WYDR094W 336 nt9.16□□□□□ -0.94
RRI1Q12468 VPS75YNL246W 795 nt9.15□□□□□ -0.94
RRI1Q12468 RRT5YFR032C 870 nt9.11□□□□□ -0.95
RRI1Q12468 YFL066CYFL066C 1179 nt9.09□□□□□ -0.95
RRI1Q12468 DAT1YML113W 747 nt9.07□□□□□ -0.96
RRI1Q12468 PAU7YAR020C 168 nt9.06□□□□□ -0.96
RRI1Q12468 NIT1YIL164C 600 nt9.05□□□□□ -0.96
RRI1Q12468 SGT2YOR007C 1041 nt9.04□□□□□ -0.96
RRI1Q12468 STR3YGL184C 1398 nt9.03□□□□□ -0.96
RRI1Q12468 YCR102CYCR102C 1107 nt9.03□□□□□ -0.96
RRI1Q12468 AQY2YLL052C 450 nt9.03□□□□□ -0.96
RRI1Q12468 DUT1YBR252W 444 nt9.03□□□□□ -0.96
RRI1Q12468 PRE6YOL038W 765 nt9.01□□□□□ -0.97
RRI1Q12468 UBX6YJL048C 1191 nt9□□□□□ -0.97
RRI1Q12468 NDI1YML120C 1542 nt9□□□□□ -0.97
RRI1Q12468 YAT1YAR035W 2064 nt8.99□□□□□ -0.97
RRI1Q12468 HSL7YBR133C 2484 nt8.99□□□□□ -0.97
RRI1Q12468 FRE6YLL051C 2139 nt8.98□□□□□ -0.97
RRI1Q12468 RDN18-1RDN18-1 1800 nt8.97□□□□□ -0.97
RRI1Q12468 RDN18-2RDN18-2 1800 nt8.97□□□□□ -0.97
RRI1Q12468 RTN2YDL204W 1182 nt8.96□□□□□ -0.98
RRI1Q12468 PAU16YKL224C 372 nt8.96□□□□□ -0.98
RRI1Q12468 NBP35YGL091C 987 nt8.91□□□□□ -0.98
RRI1Q12468 MIR1YJR077C 936 nt8.9□□□□□ -0.98
RRI1Q12468 NAT4YMR069W 858 nt8.89□□□□□ -0.99
RRI1Q12468 THI74YDR438W 1113 nt8.88□□□□□ -0.99
RRI1Q12468 SHB17YKR043C 816 nt8.88□□□□□ -0.99
RRI1Q12468 SPT20YOL148C 1815 nt8.88□□□□□ -0.99
RRI1Q12468 TIR3YIL011W 810 nt8.86□□□□□ -0.99
RRI1Q12468 LSC2YGR244C 1284 nt8.84□□□□□ -0.99
RRI1Q12468 UBA4YHR111W 1323 nt8.83□□□□□ -1
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 7.5 ms