Protein–RNA interactions for Protein: Q12074

SPE3, Spermidine synthase, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 293 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SPE3Q12074 AHT1YHR093W 549 nt11.38□□□□□ -0.59
SPE3Q12074 WSC2YNL283C 1512 nt11.38□□□□□ -0.59
SPE3Q12074 YLL053CYLL053C 459 nt11.37□□□□□ -0.59
SPE3Q12074 AQY1YPR192W 918 nt11.35□□□□□ -0.59
SPE3Q12074 ERF2YLR246W 1080 nt11.34□□□□□ -0.59
SPE3Q12074 NAT4YMR069W 858 nt11.33□□□□□ -0.6
SPE3Q12074 YFL066CYFL066C 1179 nt11.32□□□□□ -0.6
SPE3Q12074 PEX25YPL112C 1185 nt11.32□□□□□ -0.6
SPE3Q12074 FTR1YER145C 1215 nt11.31□□□□□ -0.6
SPE3Q12074 GLK1YCL040W 1503 nt11.29□□□□□ -0.6
SPE3Q12074 PTK1YKL198C 1989 nt11.27□□□□□ -0.61
SPE3Q12074 YLR415CYLR415C 339 nt11.27□□□□□ -0.61
SPE3Q12074 GAL1YBR020W 1587 nt11.27□□□□□ -0.61
SPE3Q12074 YFL067WYFL067W 528 nt11.25□□□□□ -0.61
SPE3Q12074 CRR1YLR213C 1269 nt11.25□□□□□ -0.61
SPE3Q12074 TRM5YHR070W 1500 nt11.25□□□□□ -0.61
SPE3Q12074 YNL115CYNL115C 1935 nt11.23□□□□□ -0.61
SPE3Q12074 LYS4YDR234W 2082 nt11.22□□□□□ -0.61
SPE3Q12074 STB1YNL309W 1263 nt11.22□□□□□ -0.61
SPE3Q12074 DDR2YOL052C-A 186 nt11.22□□□□□ -0.61
SPE3Q12074 ATF2YGR177C 1608 nt11.21□□□□□ -0.61
SPE3Q12074 SWC5YBR231C 912 nt11.21□□□□□ -0.61
SPE3Q12074 BDH1YAL060W 1149 nt11.2□□□□□ -0.62
SPE3Q12074 YDR524C-BYDR524C-B 201 nt11.19□□□□□ -0.62
SPE3Q12074 CCT4YDL143W 1587 nt11.19□□□□□ -0.62
SPE3Q12074 GPI16YHR188C 1833 nt11.19□□□□□ -0.62
SPE3Q12074 YSP3YOR003W 1437 nt11.18□□□□□ -0.62
SPE3Q12074 HEM12YDR047W 1089 nt11.17□□□□□ -0.62
SPE3Q12074 SPC25YER018C 666 nt11.15□□□□□ -0.62
SPE3Q12074 YFL054CYFL054C 1941 nt11.15□□□□□ -0.62
SPE3Q12074 YDL086C-AYDL086C-A 435 nt11.14□□□□□ -0.63
SPE3Q12074 MSF1YPR047W 1410 nt11.13□□□□□ -0.63
SPE3Q12074 SNG1YGR197C 1644 nt11.11□□□□□ -0.63
SPE3Q12074 THI74YDR438W 1113 nt11.11□□□□□ -0.63
SPE3Q12074 VPS60YDR486C 690 nt11.1□□□□□ -0.63
SPE3Q12074 PAU7YAR020C 168 nt11.09□□□□□ -0.63
SPE3Q12074 RDN37-1RDN37-1 5354 nt11.09□□□□□ -0.63
SPE3Q12074 RDN37-2RDN37-2 5354 nt11.09□□□□□ -0.63
SPE3Q12074 VPS75YNL246W 795 nt11.08□□□□□ -0.64
SPE3Q12074 MIC10YCL057C-A 294 nt11.08□□□□□ -0.64
SPE3Q12074 ANP1YEL036C 1503 nt11.07□□□□□ -0.64
SPE3Q12074 MIR1YJR077C 936 nt11.04□□□□□ -0.64
SPE3Q12074 FEN2YCR028C 1539 nt11.04□□□□□ -0.64
SPE3Q12074 YHR056W-AYHR056W-A 435 nt11.03□□□□□ -0.64
SPE3Q12074 UME6YDR207C 2511 nt11.01□□□□□ -0.65
SPE3Q12074 SPT8YLR055C 1809 nt11.01□□□□□ -0.65
SPE3Q12074 ALG3YBL082C 1377 nt11.01□□□□□ -0.65
SPE3Q12074 RAX1YOR301W 1308 nt10.99□□□□□ -0.65
SPE3Q12074 BNA2YJR078W 1362 nt10.98□□□□□ -0.65
SPE3Q12074 TIM17YJL143W 477 nt10.97□□□□□ -0.65
SPE3Q12074 BOR1YNL275W 1731 nt10.95□□□□□ -0.66
SPE3Q12074 YIR016WYIR016W 798 nt10.94□□□□□ -0.66
SPE3Q12074 DAT1YML113W 747 nt10.94□□□□□ -0.66
SPE3Q12074 GLR1YPL091W 1452 nt10.91□□□□□ -0.66
SPE3Q12074 YMR244WYMR244W 1068 nt10.9□□□□□ -0.66
SPE3Q12074 YGL034CYGL034C 366 nt10.89□□□□□ -0.67
SPE3Q12074 YSR3YKR053C 1215 nt10.88□□□□□ -0.67
SPE3Q12074 SWE1YJL187C 2460 nt10.87□□□□□ -0.67
SPE3Q12074 MIC12YBR262C 321 nt10.87□□□□□ -0.67
SPE3Q12074 UBA4YHR111W 1323 nt10.86□□□□□ -0.67
SPE3Q12074 SHB17YKR043C 816 nt10.84□□□□□ -0.67
SPE3Q12074 NDI1YML120C 1542 nt10.84□□□□□ -0.67
SPE3Q12074 HHO1YPL127C 777 nt10.82□□□□□ -0.68
SPE3Q12074 SHM2YLR058C 1410 nt10.82□□□□□ -0.68
SPE3Q12074 RBG1YAL036C 1110 nt10.8□□□□□ -0.68
SPE3Q12074 XDJ1YLR090W 1380 nt10.79□□□□□ -0.68
SPE3Q12074 YGR201CYGR201C 678 nt10.78□□□□□ -0.68
SPE3Q12074 CCA1YER168C 1641 nt10.77□□□□□ -0.68
SPE3Q12074 XYL2YLR070C 1071 nt10.77□□□□□ -0.69
SPE3Q12074 YCR087WYCR087W 516 nt10.74□□□□□ -0.69
SPE3Q12074 SGT2YOR007C 1041 nt10.74□□□□□ -0.69
SPE3Q12074 RBG2YGR173W 1107 nt10.73□□□□□ -0.69
SPE3Q12074 GDH3YAL062W 1374 nt10.73□□□□□ -0.69
SPE3Q12074 PHO89YBR296C 1725 nt10.72□□□□□ -0.69
SPE3Q12074 YDR010CYDR010C 333 nt10.68□□□□□ -0.7
SPE3Q12074 MCH5YOR306C 1566 nt10.68□□□□□ -0.7
SPE3Q12074 RET2YFR051C 1641 nt10.66□□□□□ -0.7
SPE3Q12074 AVT6YER119C 1347 nt10.65□□□□□ -0.7
SPE3Q12074 NIT1YIL164C 600 nt10.65□□□□□ -0.7
SPE3Q12074 AIM45YPR004C 1035 nt10.65□□□□□ -0.7
SPE3Q12074 MRP20YDR405W 792 nt10.64□□□□□ -0.71
SPE3Q12074 GOR1YNL274C 1053 nt10.64□□□□□ -0.71
SPE3Q12074 AGP1YCL025C 1902 nt10.64□□□□□ -0.71
SPE3Q12074 DUS1YML080W 1272 nt10.62□□□□□ -0.71
SPE3Q12074 YMR226CYMR226C 804 nt10.61□□□□□ -0.71
SPE3Q12074 YLR111WYLR111W 333 nt10.58□□□□□ -0.72
SPE3Q12074 HSP60YLR259C 1719 nt10.57□□□□□ -0.72
SPE3Q12074 ALG12YNR030W 1656 nt10.55□□□□□ -0.72
SPE3Q12074 FUR4YBR021W 1902 nt10.54□□□□□ -0.72
SPE3Q12074 YCL074WYCL074W 927 nt10.53□□□□□ -0.72
SPE3Q12074 SDH5YOL071W 489 nt10.51□□□□□ -0.73
SPE3Q12074 DUT1YBR252W 444 nt10.51□□□□□ -0.73
SPE3Q12074 YCR102CYCR102C 1107 nt10.5□□□□□ -0.73
SPE3Q12074 COQ2YNR041C 1119 nt10.5□□□□□ -0.73
SPE3Q12074 SAM1YLR180W 1149 nt10.47□□□□□ -0.73
SPE3Q12074 YHL019W-AYHL019W-A 594 nt10.46□□□□□ -0.73
SPE3Q12074 CLB6YGR109C 1143 nt10.45□□□□□ -0.74
SPE3Q12074 STR3YGL184C 1398 nt10.44□□□□□ -0.74
SPE3Q12074 AQY2YLL052C 450 nt10.44□□□□□ -0.74
SPE3Q12074 RPL4BYDR012W 1089 nt10.43□□□□□ -0.74
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