Protein–RNA interactions for Protein: Q0VAY3

Fam187b, Protein FAM187B, mousemouse

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam187bQ0VAY3 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Fam187bQ0VAY3 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Fam187bQ0VAY3 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Fam187bQ0VAY3 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
Fam187bQ0VAY3 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Fam187bQ0VAY3 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Fam187bQ0VAY3 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Fam187bQ0VAY3 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Fam187bQ0VAY3 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Fam187bQ0VAY3 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Fam187bQ0VAY3 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Fam187bQ0VAY3 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Fam187bQ0VAY3 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Fam187bQ0VAY3 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Fam187bQ0VAY3 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Fam187bQ0VAY3 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Fam187bQ0VAY3 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Fam187bQ0VAY3 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Fam187bQ0VAY3 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Fam187bQ0VAY3 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Fam187bQ0VAY3 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Fam187bQ0VAY3 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Fam187bQ0VAY3 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Fam187bQ0VAY3 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Fam187bQ0VAY3 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Fam187bQ0VAY3 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Fam187bQ0VAY3 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Fam187bQ0VAY3 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Fam187bQ0VAY3 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Fam187bQ0VAY3 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Fam187bQ0VAY3 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Fam187bQ0VAY3 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Fam187bQ0VAY3 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Fam187bQ0VAY3 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Fam187bQ0VAY3 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Fam187bQ0VAY3 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Fam187bQ0VAY3 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Fam187bQ0VAY3 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Fam187bQ0VAY3 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Fam187bQ0VAY3 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Fam187bQ0VAY3 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Fam187bQ0VAY3 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Fam187bQ0VAY3 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Fam187bQ0VAY3 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Fam187bQ0VAY3 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Fam187bQ0VAY3 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Fam187bQ0VAY3 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Fam187bQ0VAY3 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Fam187bQ0VAY3 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Fam187bQ0VAY3 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Fam187bQ0VAY3 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Fam187bQ0VAY3 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Fam187bQ0VAY3 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Fam187bQ0VAY3 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Fam187bQ0VAY3 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Fam187bQ0VAY3 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Fam187bQ0VAY3 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Fam187bQ0VAY3 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Fam187bQ0VAY3 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Fam187bQ0VAY3 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Fam187bQ0VAY3 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Fam187bQ0VAY3 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Fam187bQ0VAY3 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Fam187bQ0VAY3 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Fam187bQ0VAY3 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Fam187bQ0VAY3 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Fam187bQ0VAY3 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Fam187bQ0VAY3 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Fam187bQ0VAY3 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Fam187bQ0VAY3 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Fam187bQ0VAY3 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Fam187bQ0VAY3 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Fam187bQ0VAY3 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Fam187bQ0VAY3 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Fam187bQ0VAY3 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Fam187bQ0VAY3 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Fam187bQ0VAY3 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Fam187bQ0VAY3 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Fam187bQ0VAY3 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Fam187bQ0VAY3 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Fam187bQ0VAY3 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Fam187bQ0VAY3 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Fam187bQ0VAY3 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Fam187bQ0VAY3 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Fam187bQ0VAY3 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Fam187bQ0VAY3 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Fam187bQ0VAY3 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Fam187bQ0VAY3 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Fam187bQ0VAY3 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Fam187bQ0VAY3 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Fam187bQ0VAY3 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Fam187bQ0VAY3 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Fam187bQ0VAY3 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Fam187bQ0VAY3 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Fam187bQ0VAY3 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Fam187bQ0VAY3 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Fam187bQ0VAY3 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Fam187bQ0VAY3 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Fam187bQ0VAY3 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Fam187bQ0VAY3 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.6 ms