Protein–RNA interactions for Protein: Q08423

Tff1, Trefoil factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 87 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tff1Q08423 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tff1Q08423 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tff1Q08423 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tff1Q08423 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Tff1Q08423 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tff1Q08423 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tff1Q08423 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Tff1Q08423 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tff1Q08423 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tff1Q08423 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tff1Q08423 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tff1Q08423 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tff1Q08423 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tff1Q08423 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tff1Q08423 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tff1Q08423 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Tff1Q08423 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Tff1Q08423 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Tff1Q08423 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tff1Q08423 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Tff1Q08423 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tff1Q08423 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tff1Q08423 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tff1Q08423 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tff1Q08423 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
Tff1Q08423 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Tff1Q08423 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Tff1Q08423 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Tff1Q08423 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Tff1Q08423 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Tff1Q08423 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Tff1Q08423 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Tff1Q08423 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Tff1Q08423 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Tff1Q08423 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Tff1Q08423 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Tff1Q08423 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Tff1Q08423 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Tff1Q08423 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Tff1Q08423 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Tff1Q08423 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Tff1Q08423 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Tff1Q08423 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Tff1Q08423 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Tff1Q08423 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Tff1Q08423 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Tff1Q08423 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Tff1Q08423 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Tff1Q08423 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Tff1Q08423 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Tff1Q08423 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Tff1Q08423 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Tff1Q08423 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Tff1Q08423 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Tff1Q08423 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Tff1Q08423 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Tff1Q08423 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Tff1Q08423 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Tff1Q08423 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Tff1Q08423 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Tff1Q08423 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Tff1Q08423 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Tff1Q08423 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Tff1Q08423 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Tff1Q08423 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Tff1Q08423 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Tff1Q08423 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Tff1Q08423 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Tff1Q08423 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Tff1Q08423 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Tff1Q08423 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Tff1Q08423 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Tff1Q08423 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Tff1Q08423 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Tff1Q08423 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Tff1Q08423 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Tff1Q08423 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
Tff1Q08423 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Tff1Q08423 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Tff1Q08423 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Tff1Q08423 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Tff1Q08423 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Tff1Q08423 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Tff1Q08423 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Tff1Q08423 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Tff1Q08423 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Tff1Q08423 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Tff1Q08423 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Tff1Q08423 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Tff1Q08423 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Tff1Q08423 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Tff1Q08423 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Tff1Q08423 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Tff1Q08423 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Tff1Q08423 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
Tff1Q08423 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Tff1Q08423 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Tff1Q08423 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
Tff1Q08423 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
Tff1Q08423 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.9 ms