Protein–RNA interactions for Protein: Q06349

DXO1, Decapping and exoribonuclease protein 1, yeastyeast

Predictions only

Length 442 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
DXO1Q06349 YCL074WYCL074W 927 nt8.97□□□□□ -0.97
DXO1Q06349 YOL037CYOL037C 354 nt8.94□□□□□ -0.98
DXO1Q06349 YLR154C-GYLR154C-G 150 nt8.93□□□□□ -0.98
DXO1Q06349 HOL1YNR055C 1761 nt8.93□□□□□ -0.98
DXO1Q06349 GTB1YDR221W 2109 nt8.93□□□□□ -0.98
DXO1Q06349 CRR1YLR213C 1269 nt8.91□□□□□ -0.98
DXO1Q06349 YCL048W-AYCL048W-A 240 nt8.91□□□□□ -0.98
DXO1Q06349 ESBP6YNL125C 2022 nt8.9□□□□□ -0.98
DXO1Q06349 IMP2'YIL154C 1041 nt8.89□□□□□ -0.99
DXO1Q06349 YHL008CYHL008C 1884 nt8.88□□□□□ -0.99
DXO1Q06349 ERF2YLR246W 1080 nt8.88□□□□□ -0.99
DXO1Q06349 ILV2YMR108W 2064 nt8.88□□□□□ -0.99
DXO1Q06349 DUS1YML080W 1272 nt8.87□□□□□ -0.99
DXO1Q06349 PCM1YEL058W 1674 nt8.87□□□□□ -0.99
DXO1Q06349 YMR209CYMR209C 1374 nt8.86□□□□□ -0.99
DXO1Q06349 GAL1YBR020W 1587 nt8.86□□□□□ -0.99
DXO1Q06349 YJL152WYJL152W 360 nt8.85□□□□□ -0.99
DXO1Q06349 LPX1YOR084W 1164 nt8.85□□□□□ -0.99
DXO1Q06349 THI72YOR192C 1800 nt8.84□□□□□ -0.99
DXO1Q06349 MIC10YCL057C-A 294 nt8.84□□□□□ -0.99
DXO1Q06349 HEM12YDR047W 1089 nt8.82□□□□□ -1
DXO1Q06349 AGP1YCL025C 1902 nt8.8□□□□□ -1
DXO1Q06349 HXK1YFR053C 1458 nt8.77□□□□□ -1
DXO1Q06349 FMP52YER004W 696 nt8.77□□□□□ -1.01
DXO1Q06349 GAL2YLR081W 1725 nt8.75□□□□□ -1.01
DXO1Q06349 RFC1YOR217W 2586 nt8.74□□□□□ -1.01
DXO1Q06349 ALD5YER073W 1563 nt8.73□□□□□ -1.01
DXO1Q06349 DTR1YBR180W 1719 nt8.73□□□□□ -1.01
DXO1Q06349 YOR139CYOR139C 393 nt8.72□□□□□ -1.01
DXO1Q06349 WHI5YOR083W 888 nt8.71□□□□□ -1.02
DXO1Q06349 RRD1YIL153W 1182 nt8.7□□□□□ -1.02
DXO1Q06349 RDN18-1RDN18-1 1800 nt8.7□□□□□ -1.02
DXO1Q06349 RDN18-2RDN18-2 1800 nt8.7□□□□□ -1.02
DXO1Q06349 BSP1YPR171W 1731 nt8.69□□□□□ -1.02
DXO1Q06349 GDH3YAL062W 1374 nt8.69□□□□□ -1.02
DXO1Q06349 PSD1YNL169C 1503 nt8.68□□□□□ -1.02
DXO1Q06349 TOK1YJL093C 2076 nt8.67□□□□□ -1.02
DXO1Q06349 IDH1YNL037C 1083 nt8.67□□□□□ -1.02
DXO1Q06349 HIF1YLL022C 1158 nt8.65□□□□□ -1.02
DXO1Q06349 SNF6YHL025W 999 nt8.64□□□□□ -1.03
DXO1Q06349 ATF2YGR177C 1608 nt8.63□□□□□ -1.03
DXO1Q06349 HIS2YFR025C 1008 nt8.62□□□□□ -1.03
DXO1Q06349 GBP2YCL011C 1284 nt8.62□□□□□ -1.03
DXO1Q06349 UGP1YKL035W 1500 nt8.61□□□□□ -1.03
DXO1Q06349 YNL024CYNL024C 741 nt8.61□□□□□ -1.03
DXO1Q06349 STR3YGL184C 1398 nt8.61□□□□□ -1.03
DXO1Q06349 TCD2YKL027W 1344 nt8.59□□□□□ -1.03
DXO1Q06349 MTO1YGL236C 2010 nt8.59□□□□□ -1.03
DXO1Q06349 BNA2YJR078W 1362 nt8.59□□□□□ -1.03
DXO1Q06349 MEP3YPR138C 1470 nt8.57□□□□□ -1.04
DXO1Q06349 RTN2YDL204W 1182 nt8.57□□□□□ -1.04
DXO1Q06349 ADH2YMR303C 1047 nt8.57□□□□□ -1.04
DXO1Q06349 CYT1YOR065W 930 nt8.57□□□□□ -1.04
DXO1Q06349 NRT1YOR071C 1797 nt8.57□□□□□ -1.04
DXO1Q06349 YFL067WYFL067W 528 nt8.56□□□□□ -1.04
DXO1Q06349 MIC12YBR262C 321 nt8.56□□□□□ -1.04
DXO1Q06349 ILV3YJR016C 1758 nt8.56□□□□□ -1.04
DXO1Q06349 FMT1YBL013W 1206 nt8.55□□□□□ -1.04
DXO1Q06349 ALD4YOR374W 1560 nt8.52□□□□□ -1.04
DXO1Q06349 SOR2YDL246C 1074 nt8.52□□□□□ -1.05
DXO1Q06349 SOR1YJR159W 1074 nt8.52□□□□□ -1.05
DXO1Q06349 YLL053CYLL053C 459 nt8.52□□□□□ -1.05
DXO1Q06349 COQ8YGL119W 1506 nt8.52□□□□□ -1.05
DXO1Q06349 UBX6YJL048C 1191 nt8.5□□□□□ -1.05
DXO1Q06349 CWP1YKL096W 720 nt8.5□□□□□ -1.05
DXO1Q06349 XDJ1YLR090W 1380 nt8.48□□□□□ -1.05
DXO1Q06349 YIH1YCR059C 777 nt8.48□□□□□ -1.05
DXO1Q06349 YOR072WYOR072W 315 nt8.48□□□□□ -1.05
DXO1Q06349 DMA2YNL116W 1569 nt8.48□□□□□ -1.05
DXO1Q06349 ALG3YBL082C 1377 nt8.48□□□□□ -1.05
DXO1Q06349 HHO1YPL127C 777 nt8.47□□□□□ -1.05
DXO1Q06349 ZRT3YKL175W 1512 nt8.47□□□□□ -1.05
DXO1Q06349 PUS2YGL063W 1113 nt8.46□□□□□ -1.06
DXO1Q06349 YOR325WYOR325W 474 nt8.46□□□□□ -1.06
DXO1Q06349 MDL2YPL270W 2322 nt8.46□□□□□ -1.06
DXO1Q06349 PCP1YGR101W 1041 nt8.45□□□□□ -1.06
DXO1Q06349 AQY2YLL052C 450 nt8.44□□□□□ -1.06
DXO1Q06349 FMP45YDL222C 930 nt8.43□□□□□ -1.06
DXO1Q06349 YDR433WYDR433W 441 nt8.43□□□□□ -1.06
DXO1Q06349 ERV46YAL042W 1248 nt8.43□□□□□ -1.06
DXO1Q06349 PRM5YIL117C 957 nt8.42□□□□□ -1.06
DXO1Q06349 YJL067WYJL067W 351 nt8.42□□□□□ -1.06
DXO1Q06349 YDL086C-AYDL086C-A 435 nt8.41□□□□□ -1.06
DXO1Q06349 YHR218WYHR218W 1812 nt8.4□□□□□ -1.06
DXO1Q06349 RSC8YFR037C 1674 nt8.4□□□□□ -1.06
DXO1Q06349 ANP1YEL036C 1503 nt8.4□□□□□ -1.06
DXO1Q06349 tM(CAU)CtM(CAU)C 72 nt8.4□□□□□ -1.06
DXO1Q06349 IMT4tM(CAU)E 72 nt8.4□□□□□ -1.06
DXO1Q06349 IMT3tM(CAU)J3 72 nt8.4□□□□□ -1.06
DXO1Q06349 IMT1tM(CAU)O1 72 nt8.4□□□□□ -1.06
DXO1Q06349 IMT2tM(CAU)P 72 nt8.4□□□□□ -1.06
DXO1Q06349 DDR2YOL052C-A 186 nt8.4□□□□□ -1.06
DXO1Q06349 YCL042WYCL042W 360 nt8.4□□□□□ -1.06
DXO1Q06349 TAD3YLR316C 969 nt8.39□□□□□ -1.07
DXO1Q06349 YPR011CYPR011C 981 nt8.39□□□□□ -1.07
DXO1Q06349 MXR2YCL033C 507 nt8.39□□□□□ -1.07
DXO1Q06349 ARO8YGL202W 1503 nt8.39□□□□□ -1.07
DXO1Q06349 SGA1YIL099W 1650 nt8.38□□□□□ -1.07
DXO1Q06349 RNQ1YCL028W 1218 nt8.38□□□□□ -1.07
DXO1Q06349 MEX67YPL169C 1800 nt8.38□□□□□ -1.07
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