Protein–RNA interactions for Protein: Q06180

Ptpn2, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 2, mousemouse

Predictions only

Length 406 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptpn2Q06180 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ptpn2Q06180 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ptpn2Q06180 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ptpn2Q06180 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ptpn2Q06180 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ptpn2Q06180 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ptpn2Q06180 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ptpn2Q06180 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ptpn2Q06180 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ptpn2Q06180 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ptpn2Q06180 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ptpn2Q06180 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ptpn2Q06180 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ptpn2Q06180 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ptpn2Q06180 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ptpn2Q06180 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ptpn2Q06180 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ptpn2Q06180 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ptpn2Q06180 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ptpn2Q06180 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Ptpn2Q06180 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
Ptpn2Q06180 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ptpn2Q06180 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ptpn2Q06180 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ptpn2Q06180 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ptpn2Q06180 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ptpn2Q06180 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ptpn2Q06180 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ptpn2Q06180 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ptpn2Q06180 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ptpn2Q06180 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Ptpn2Q06180 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Ptpn2Q06180 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Ptpn2Q06180 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ptpn2Q06180 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ptpn2Q06180 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ptpn2Q06180 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ptpn2Q06180 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ptpn2Q06180 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ptpn2Q06180 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ptpn2Q06180 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ptpn2Q06180 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ptpn2Q06180 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ptpn2Q06180 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ptpn2Q06180 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ptpn2Q06180 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ptpn2Q06180 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ptpn2Q06180 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
Ptpn2Q06180 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Ptpn2Q06180 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ptpn2Q06180 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ptpn2Q06180 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ptpn2Q06180 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ptpn2Q06180 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
Ptpn2Q06180 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ptpn2Q06180 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ptpn2Q06180 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ptpn2Q06180 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ptpn2Q06180 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ptpn2Q06180 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ptpn2Q06180 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
Ptpn2Q06180 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ptpn2Q06180 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ptpn2Q06180 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ptpn2Q06180 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ptpn2Q06180 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ptpn2Q06180 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ptpn2Q06180 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ptpn2Q06180 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ptpn2Q06180 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ptpn2Q06180 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ptpn2Q06180 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Ptpn2Q06180 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
Ptpn2Q06180 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Ptpn2Q06180 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ptpn2Q06180 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ptpn2Q06180 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ptpn2Q06180 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ptpn2Q06180 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ptpn2Q06180 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ptpn2Q06180 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ptpn2Q06180 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Ptpn2Q06180 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ptpn2Q06180 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Ptpn2Q06180 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ptpn2Q06180 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ptpn2Q06180 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ptpn2Q06180 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ptpn2Q06180 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ptpn2Q06180 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ptpn2Q06180 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ptpn2Q06180 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ptpn2Q06180 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ptpn2Q06180 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ptpn2Q06180 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ptpn2Q06180 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ptpn2Q06180 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ptpn2Q06180 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ptpn2Q06180 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ptpn2Q06180 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.6 ms