Protein–RNA interactions for Protein: Q05738

Sry, Sex-determining region Y protein, mousemouse

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SryQ05738 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
SryQ05738 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SryQ05738 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SryQ05738 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SryQ05738 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SryQ05738 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SryQ05738 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SryQ05738 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SryQ05738 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
SryQ05738 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SryQ05738 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SryQ05738 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SryQ05738 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SryQ05738 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SryQ05738 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SryQ05738 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SryQ05738 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SryQ05738 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SryQ05738 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SryQ05738 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SryQ05738 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SryQ05738 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SryQ05738 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SryQ05738 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SryQ05738 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SryQ05738 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SryQ05738 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SryQ05738 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SryQ05738 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SryQ05738 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SryQ05738 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SryQ05738 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SryQ05738 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SryQ05738 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SryQ05738 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SryQ05738 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SryQ05738 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SryQ05738 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SryQ05738 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SryQ05738 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SryQ05738 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SryQ05738 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SryQ05738 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SryQ05738 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SryQ05738 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SryQ05738 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SryQ05738 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
SryQ05738 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SryQ05738 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SryQ05738 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SryQ05738 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
SryQ05738 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SryQ05738 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
SryQ05738 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SryQ05738 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SryQ05738 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SryQ05738 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SryQ05738 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SryQ05738 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SryQ05738 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SryQ05738 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SryQ05738 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
SryQ05738 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SryQ05738 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SryQ05738 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SryQ05738 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SryQ05738 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SryQ05738 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SryQ05738 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SryQ05738 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SryQ05738 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SryQ05738 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SryQ05738 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SryQ05738 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SryQ05738 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SryQ05738 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SryQ05738 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SryQ05738 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SryQ05738 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SryQ05738 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SryQ05738 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
SryQ05738 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SryQ05738 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SryQ05738 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SryQ05738 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SryQ05738 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SryQ05738 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SryQ05738 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SryQ05738 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SryQ05738 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SryQ05738 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SryQ05738 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SryQ05738 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SryQ05738 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SryQ05738 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SryQ05738 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SryQ05738 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SryQ05738 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SryQ05738 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SryQ05738 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms