Protein–RNA interactions for Protein: Q03954

SPC19, DASH complex subunit SPC19, yeastyeast

Predictions only

Length 165 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SPC19Q03954 GAL1YBR020W 1587 nt9.93□□□□□ -0.82
SPC19Q03954 TRM5YHR070W 1500 nt9.93□□□□□ -0.82
SPC19Q03954 YHR056W-AYHR056W-A 435 nt9.93□□□□□ -0.82
SPC19Q03954 AQY1YPR192W 918 nt9.93□□□□□ -0.82
SPC19Q03954 TIM23YNR017W 669 nt9.9□□□□□ -0.82
SPC19Q03954 SNG1YGR197C 1644 nt9.89□□□□□ -0.83
SPC19Q03954 RAX1YOR301W 1308 nt9.89□□□□□ -0.83
SPC19Q03954 SPP1YPL138C 1062 nt9.89□□□□□ -0.83
SPC19Q03954 MIC10YCL057C-A 294 nt9.89□□□□□ -0.83
SPC19Q03954 YDL086C-AYDL086C-A 435 nt9.88□□□□□ -0.83
SPC19Q03954 YLR179CYLR179C 606 nt9.88□□□□□ -0.83
SPC19Q03954 BNA2YJR078W 1362 nt9.87□□□□□ -0.83
SPC19Q03954 YDR510C-AYDR510C-A 117 nt9.85□□□□□ -0.83
SPC19Q03954 YKL030WYKL030W 606 nt9.83□□□□□ -0.84
SPC19Q03954 YDR524C-BYDR524C-B 201 nt9.82□□□□□ -0.84
SPC19Q03954 STB1YNL309W 1263 nt9.82□□□□□ -0.84
SPC19Q03954 GPI16YHR188C 1833 nt9.81□□□□□ -0.84
SPC19Q03954 ANP1YEL036C 1503 nt9.79□□□□□ -0.84
SPC19Q03954 SPC25YER018C 666 nt9.77□□□□□ -0.85
SPC19Q03954 MAS1YLR163C 1389 nt9.76□□□□□ -0.85
SPC19Q03954 YPR064WYPR064W 420 nt9.76□□□□□ -0.85
SPC19Q03954 CCA1YER168C 1641 nt9.75□□□□□ -0.85
SPC19Q03954 FEN2YCR028C 1539 nt9.75□□□□□ -0.85
SPC19Q03954 GID7YCL039W 2238 nt9.74□□□□□ -0.85
SPC19Q03954 SWC5YBR231C 912 nt9.74□□□□□ -0.85
SPC19Q03954 CCT4YDL143W 1587 nt9.71□□□□□ -0.85
SPC19Q03954 AHT1YHR093W 549 nt9.71□□□□□ -0.86
SPC19Q03954 VPS60YDR486C 690 nt9.69□□□□□ -0.86
SPC19Q03954 HSP60YLR259C 1719 nt9.69□□□□□ -0.86
SPC19Q03954 WSC2YNL283C 1512 nt9.68□□□□□ -0.86
SPC19Q03954 GLK1YCL040W 1503 nt9.68□□□□□ -0.86
SPC19Q03954 HHO1YPL127C 777 nt9.68□□□□□ -0.86
SPC19Q03954 FUR4YBR021W 1902 nt9.67□□□□□ -0.86
SPC19Q03954 DUS1YML080W 1272 nt9.67□□□□□ -0.86
SPC19Q03954 MIC12YBR262C 321 nt9.67□□□□□ -0.86
SPC19Q03954 YIR016WYIR016W 798 nt9.66□□□□□ -0.86
SPC19Q03954 TAD3YLR316C 969 nt9.65□□□□□ -0.86
SPC19Q03954 YGR201CYGR201C 678 nt9.61□□□□□ -0.87
SPC19Q03954 RTG1YOL067C 534 nt9.59□□□□□ -0.87
SPC19Q03954 ALG3YBL082C 1377 nt9.59□□□□□ -0.87
SPC19Q03954 HUA1YGR268C 597 nt9.58□□□□□ -0.88
SPC19Q03954 BMT6YLR063W 1098 nt9.57□□□□□ -0.88
SPC19Q03954 YCL074WYCL074W 927 nt9.56□□□□□ -0.88
SPC19Q03954 tL(GAG)GtL(GAG)G 82 nt9.56□□□□□ -0.88
SPC19Q03954 HEM14YER014W 1620 nt9.56□□□□□ -0.88
SPC19Q03954 MCM5YLR274W 2328 nt9.55□□□□□ -0.88
SPC19Q03954 PRP4YPR178W 1398 nt9.55□□□□□ -0.88
SPC19Q03954 YLR415CYLR415C 339 nt9.55□□□□□ -0.88
SPC19Q03954 ALG12YNR030W 1656 nt9.55□□□□□ -0.88
SPC19Q03954 YEL076C-AYEL076C-A 651 nt9.53□□□□□ -0.88
SPC19Q03954 YEL076CYEL076C 651 nt9.53□□□□□ -0.88
SPC19Q03954 YLR464WYLR464W 651 nt9.53□□□□□ -0.88
SPC19Q03954 AGP1YCL025C 1902 nt9.52□□□□□ -0.88
SPC19Q03954 ESBP6YNL125C 2022 nt9.52□□□□□ -0.89
SPC19Q03954 XDJ1YLR090W 1380 nt9.51□□□□□ -0.89
SPC19Q03954 GOR1YNL274C 1053 nt9.51□□□□□ -0.89
SPC19Q03954 ADO1YJR105W 1023 nt9.5□□□□□ -0.89
SPC19Q03954 AVT6YER119C 1347 nt9.5□□□□□ -0.89
SPC19Q03954 MRPL8YJL063C 717 nt9.48□□□□□ -0.89
SPC19Q03954 GDH3YAL062W 1374 nt9.48□□□□□ -0.89
SPC19Q03954 RSC4YKR008W 1878 nt9.47□□□□□ -0.89
SPC19Q03954 YKR005CYKR005C 1578 nt9.47□□□□□ -0.89
SPC19Q03954 TIM17YJL143W 477 nt9.47□□□□□ -0.89
SPC19Q03954 AAC1YMR056C 930 nt9.47□□□□□ -0.89
SPC19Q03954 DPS1YLL018C 1674 nt9.47□□□□□ -0.89
SPC19Q03954 BDH1YAL060W 1149 nt9.46□□□□□ -0.9
SPC19Q03954 YGR259CYGR259C 441 nt9.44□□□□□ -0.9
SPC19Q03954 MCH5YOR306C 1566 nt9.43□□□□□ -0.9
SPC19Q03954 AQY2YLL052C 450 nt9.42□□□□□ -0.9
SPC19Q03954 YDR306CYDR306C 1437 nt9.41□□□□□ -0.9
SPC19Q03954 DTR1YBR180W 1719 nt9.4□□□□□ -0.9
SPC19Q03954 SHM2YLR058C 1410 nt9.39□□□□□ -0.91
SPC19Q03954 STR3YGL184C 1398 nt9.37□□□□□ -0.91
SPC19Q03954 YSP3YOR003W 1437 nt9.36□□□□□ -0.91
SPC19Q03954 ILV2YMR108W 2064 nt9.36□□□□□ -0.91
SPC19Q03954 DUT1YBR252W 444 nt9.35□□□□□ -0.91
SPC19Q03954 RDN18-1RDN18-1 1800 nt9.33□□□□□ -0.92
SPC19Q03954 RDN18-2RDN18-2 1800 nt9.33□□□□□ -0.92
SPC19Q03954 IRC24YIR036C 792 nt9.33□□□□□ -0.92
SPC19Q03954 RTN2YDL204W 1182 nt9.32□□□□□ -0.92
SPC19Q03954 YNL115CYNL115C 1935 nt9.31□□□□□ -0.92
SPC19Q03954 PEX25YPL112C 1185 nt9.31□□□□□ -0.92
SPC19Q03954 NAR1YNL240C 1476 nt9.28□□□□□ -0.92
SPC19Q03954 DAT1YML113W 747 nt9.28□□□□□ -0.92
SPC19Q03954 Q0010Q0010 387 nt9.28□□□□□ -0.92
SPC19Q03954 YCR102CYCR102C 1107 nt9.27□□□□□ -0.93
SPC19Q03954 SGT2YOR007C 1041 nt9.27□□□□□ -0.93
SPC19Q03954 NIT1YIL164C 600 nt9.25□□□□□ -0.93
SPC19Q03954 VPS75YNL246W 795 nt9.25□□□□□ -0.93
SPC19Q03954 PAU7YAR020C 168 nt9.23□□□□□ -0.93
SPC19Q03954 SNF1YDR477W 1902 nt9.22□□□□□ -0.93
SPC19Q03954 MET2YNL277W 1461 nt9.21□□□□□ -0.93
SPC19Q03954 BIO5YNR056C 1686 nt9.2□□□□□ -0.94
SPC19Q03954 YFL066CYFL066C 1179 nt9.18□□□□□ -0.94
SPC19Q03954 YFR018CYFR018C 1092 nt9.18□□□□□ -0.94
SPC19Q03954 NBP35YGL091C 987 nt9.16□□□□□ -0.94
SPC19Q03954 PUS7YOR243C 2031 nt9.14□□□□□ -0.95
SPC19Q03954 YJR154WYJR154W 1041 nt9.13□□□□□ -0.95
SPC19Q03954 RRT5YFR032C 870 nt9.12□□□□□ -0.95
SPC19Q03954 PBP1YGR178C 2169 nt9.11□□□□□ -0.95
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 11.4 ms