Protein–RNA interactions for Protein: Q03350

Thbs2, Thrombospondin-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Thbs2Q03350 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Thbs2Q03350 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Thbs2Q03350 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Thbs2Q03350 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Thbs2Q03350 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Thbs2Q03350 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Thbs2Q03350 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Thbs2Q03350 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Thbs2Q03350 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Thbs2Q03350 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Thbs2Q03350 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Thbs2Q03350 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Thbs2Q03350 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Thbs2Q03350 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Thbs2Q03350 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Thbs2Q03350 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Thbs2Q03350 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Thbs2Q03350 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Thbs2Q03350 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Thbs2Q03350 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Thbs2Q03350 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Thbs2Q03350 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Thbs2Q03350 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Thbs2Q03350 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Thbs2Q03350 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Thbs2Q03350 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Thbs2Q03350 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Thbs2Q03350 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Thbs2Q03350 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Thbs2Q03350 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Thbs2Q03350 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Thbs2Q03350 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Thbs2Q03350 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Thbs2Q03350 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Thbs2Q03350 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Thbs2Q03350 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Thbs2Q03350 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Thbs2Q03350 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Thbs2Q03350 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Thbs2Q03350 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Thbs2Q03350 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Thbs2Q03350 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Thbs2Q03350 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Thbs2Q03350 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Thbs2Q03350 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Thbs2Q03350 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Thbs2Q03350 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Thbs2Q03350 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Thbs2Q03350 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Thbs2Q03350 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Thbs2Q03350 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Thbs2Q03350 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Thbs2Q03350 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Thbs2Q03350 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Thbs2Q03350 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Thbs2Q03350 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Thbs2Q03350 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Thbs2Q03350 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Thbs2Q03350 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Thbs2Q03350 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Thbs2Q03350 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Thbs2Q03350 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Thbs2Q03350 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Thbs2Q03350 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Thbs2Q03350 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Thbs2Q03350 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Thbs2Q03350 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Thbs2Q03350 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Thbs2Q03350 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Thbs2Q03350 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Thbs2Q03350 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Thbs2Q03350 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Thbs2Q03350 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Thbs2Q03350 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Thbs2Q03350 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Thbs2Q03350 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Thbs2Q03350 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Thbs2Q03350 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Thbs2Q03350 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Thbs2Q03350 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Thbs2Q03350 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Thbs2Q03350 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Thbs2Q03350 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Thbs2Q03350 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Thbs2Q03350 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Thbs2Q03350 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Thbs2Q03350 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Thbs2Q03350 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Thbs2Q03350 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Thbs2Q03350 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Thbs2Q03350 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Thbs2Q03350 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Thbs2Q03350 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Thbs2Q03350 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Thbs2Q03350 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Thbs2Q03350 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Thbs2Q03350 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Thbs2Q03350 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Thbs2Q03350 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Thbs2Q03350 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.8 ms