Protein–RNA interactions for Protein: Q02650

Pax5, Paired box protein Pax-5, mousemouse

Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pax5Q02650 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Pax5Q02650 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Pax5Q02650 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Pax5Q02650 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Pax5Q02650 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Pax5Q02650 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Pax5Q02650 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Pax5Q02650 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Pax5Q02650 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Pax5Q02650 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Pax5Q02650 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Pax5Q02650 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Pax5Q02650 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Pax5Q02650 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Pax5Q02650 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Pax5Q02650 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Pax5Q02650 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Pax5Q02650 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Pax5Q02650 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Pax5Q02650 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Pax5Q02650 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Pax5Q02650 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Pax5Q02650 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Pax5Q02650 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Pax5Q02650 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Pax5Q02650 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Pax5Q02650 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Pax5Q02650 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Pax5Q02650 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Pax5Q02650 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Pax5Q02650 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Pax5Q02650 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Pax5Q02650 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Pax5Q02650 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Pax5Q02650 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Pax5Q02650 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Pax5Q02650 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Pax5Q02650 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Pax5Q02650 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Pax5Q02650 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Pax5Q02650 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Pax5Q02650 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pax5Q02650 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pax5Q02650 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Pax5Q02650 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pax5Q02650 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pax5Q02650 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pax5Q02650 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pax5Q02650 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pax5Q02650 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Pax5Q02650 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Pax5Q02650 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pax5Q02650 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pax5Q02650 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pax5Q02650 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pax5Q02650 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pax5Q02650 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pax5Q02650 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Pax5Q02650 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Pax5Q02650 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Pax5Q02650 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Pax5Q02650 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Pax5Q02650 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Pax5Q02650 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Pax5Q02650 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Pax5Q02650 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Pax5Q02650 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Pax5Q02650 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Pax5Q02650 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Pax5Q02650 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Pax5Q02650 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Pax5Q02650 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Pax5Q02650 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Pax5Q02650 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Pax5Q02650 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pax5Q02650 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pax5Q02650 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pax5Q02650 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pax5Q02650 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Pax5Q02650 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Pax5Q02650 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Pax5Q02650 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Pax5Q02650 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Pax5Q02650 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Pax5Q02650 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Pax5Q02650 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Pax5Q02650 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Pax5Q02650 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Pax5Q02650 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Pax5Q02650 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Pax5Q02650 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Pax5Q02650 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Pax5Q02650 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Pax5Q02650 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Pax5Q02650 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Pax5Q02650 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Pax5Q02650 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Pax5Q02650 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Pax5Q02650 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Pax5Q02650 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.9 ms