Protein–RNA interactions for Protein: Q02257

Jup, Junction plakoglobin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 745 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
JupQ02257 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
JupQ02257 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
JupQ02257 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
JupQ02257 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
JupQ02257 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
JupQ02257 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
JupQ02257 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
JupQ02257 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
JupQ02257 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
JupQ02257 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
JupQ02257 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
JupQ02257 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
JupQ02257 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
JupQ02257 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
JupQ02257 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
JupQ02257 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
JupQ02257 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
JupQ02257 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
JupQ02257 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
JupQ02257 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
JupQ02257 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
JupQ02257 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
JupQ02257 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
JupQ02257 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
JupQ02257 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
JupQ02257 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
JupQ02257 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
JupQ02257 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
JupQ02257 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
JupQ02257 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
JupQ02257 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
JupQ02257 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
JupQ02257 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
JupQ02257 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
JupQ02257 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
JupQ02257 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
JupQ02257 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
JupQ02257 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
JupQ02257 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
JupQ02257 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
JupQ02257 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
JupQ02257 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
JupQ02257 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
JupQ02257 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
JupQ02257 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
JupQ02257 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
JupQ02257 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
JupQ02257 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
JupQ02257 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
JupQ02257 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
JupQ02257 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
JupQ02257 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
JupQ02257 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
JupQ02257 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
JupQ02257 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
JupQ02257 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
JupQ02257 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
JupQ02257 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
JupQ02257 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
JupQ02257 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
JupQ02257 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
JupQ02257 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
JupQ02257 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
JupQ02257 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
JupQ02257 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
JupQ02257 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
JupQ02257 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
JupQ02257 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
JupQ02257 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
JupQ02257 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
JupQ02257 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
JupQ02257 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
JupQ02257 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
JupQ02257 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
JupQ02257 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
JupQ02257 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
JupQ02257 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
JupQ02257 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
JupQ02257 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
JupQ02257 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
JupQ02257 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
JupQ02257 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
JupQ02257 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
JupQ02257 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
JupQ02257 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
JupQ02257 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
JupQ02257 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
JupQ02257 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
JupQ02257 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
JupQ02257 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
JupQ02257 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
JupQ02257 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
JupQ02257 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
JupQ02257 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
JupQ02257 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
JupQ02257 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
JupQ02257 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
JupQ02257 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
JupQ02257 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
JupQ02257 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.3 ms