Protein–RNA interactions for Protein: Q02111

Prkcq, Protein kinase C theta type, mousemouse

Predictions only

Length 707 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkcqQ02111 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PrkcqQ02111 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PrkcqQ02111 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
PrkcqQ02111 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
PrkcqQ02111 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PrkcqQ02111 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PrkcqQ02111 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
PrkcqQ02111 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PrkcqQ02111 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PrkcqQ02111 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PrkcqQ02111 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PrkcqQ02111 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PrkcqQ02111 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PrkcqQ02111 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PrkcqQ02111 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PrkcqQ02111 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PrkcqQ02111 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
PrkcqQ02111 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PrkcqQ02111 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PrkcqQ02111 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PrkcqQ02111 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PrkcqQ02111 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PrkcqQ02111 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PrkcqQ02111 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PrkcqQ02111 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PrkcqQ02111 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PrkcqQ02111 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PrkcqQ02111 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PrkcqQ02111 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PrkcqQ02111 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
PrkcqQ02111 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PrkcqQ02111 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PrkcqQ02111 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
PrkcqQ02111 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
PrkcqQ02111 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
PrkcqQ02111 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
PrkcqQ02111 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
PrkcqQ02111 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
PrkcqQ02111 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
PrkcqQ02111 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PrkcqQ02111 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PrkcqQ02111 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PrkcqQ02111 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
PrkcqQ02111 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
PrkcqQ02111 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PrkcqQ02111 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PrkcqQ02111 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PrkcqQ02111 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PrkcqQ02111 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PrkcqQ02111 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PrkcqQ02111 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PrkcqQ02111 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PrkcqQ02111 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PrkcqQ02111 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
PrkcqQ02111 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PrkcqQ02111 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PrkcqQ02111 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PrkcqQ02111 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PrkcqQ02111 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PrkcqQ02111 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PrkcqQ02111 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
PrkcqQ02111 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PrkcqQ02111 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PrkcqQ02111 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PrkcqQ02111 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PrkcqQ02111 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PrkcqQ02111 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PrkcqQ02111 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
PrkcqQ02111 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
PrkcqQ02111 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PrkcqQ02111 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PrkcqQ02111 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PrkcqQ02111 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PrkcqQ02111 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
PrkcqQ02111 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
PrkcqQ02111 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PrkcqQ02111 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
PrkcqQ02111 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PrkcqQ02111 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PrkcqQ02111 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PrkcqQ02111 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PrkcqQ02111 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PrkcqQ02111 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PrkcqQ02111 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PrkcqQ02111 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PrkcqQ02111 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PrkcqQ02111 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PrkcqQ02111 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PrkcqQ02111 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PrkcqQ02111 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PrkcqQ02111 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PrkcqQ02111 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PrkcqQ02111 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PrkcqQ02111 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PrkcqQ02111 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PrkcqQ02111 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
PrkcqQ02111 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PrkcqQ02111 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PrkcqQ02111 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PrkcqQ02111 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12 ms