Protein–RNA interactions for Protein: Q00LT2

Prcd, Progressive rod-cone degeneration protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 53 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrcdQ00LT2 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PrcdQ00LT2 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PrcdQ00LT2 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PrcdQ00LT2 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PrcdQ00LT2 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PrcdQ00LT2 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
PrcdQ00LT2 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PrcdQ00LT2 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
PrcdQ00LT2 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PrcdQ00LT2 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PrcdQ00LT2 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PrcdQ00LT2 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PrcdQ00LT2 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PrcdQ00LT2 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PrcdQ00LT2 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PrcdQ00LT2 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PrcdQ00LT2 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PrcdQ00LT2 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PrcdQ00LT2 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
PrcdQ00LT2 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PrcdQ00LT2 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PrcdQ00LT2 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PrcdQ00LT2 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PrcdQ00LT2 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PrcdQ00LT2 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PrcdQ00LT2 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PrcdQ00LT2 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PrcdQ00LT2 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PrcdQ00LT2 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PrcdQ00LT2 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PrcdQ00LT2 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PrcdQ00LT2 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PrcdQ00LT2 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PrcdQ00LT2 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PrcdQ00LT2 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PrcdQ00LT2 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PrcdQ00LT2 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PrcdQ00LT2 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PrcdQ00LT2 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PrcdQ00LT2 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PrcdQ00LT2 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PrcdQ00LT2 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PrcdQ00LT2 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PrcdQ00LT2 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PrcdQ00LT2 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PrcdQ00LT2 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PrcdQ00LT2 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PrcdQ00LT2 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
PrcdQ00LT2 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PrcdQ00LT2 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PrcdQ00LT2 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PrcdQ00LT2 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PrcdQ00LT2 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PrcdQ00LT2 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PrcdQ00LT2 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PrcdQ00LT2 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
PrcdQ00LT2 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PrcdQ00LT2 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PrcdQ00LT2 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PrcdQ00LT2 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
PrcdQ00LT2 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PrcdQ00LT2 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PrcdQ00LT2 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PrcdQ00LT2 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PrcdQ00LT2 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PrcdQ00LT2 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PrcdQ00LT2 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PrcdQ00LT2 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PrcdQ00LT2 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PrcdQ00LT2 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PrcdQ00LT2 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PrcdQ00LT2 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PrcdQ00LT2 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PrcdQ00LT2 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PrcdQ00LT2 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
PrcdQ00LT2 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
PrcdQ00LT2 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PrcdQ00LT2 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PrcdQ00LT2 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PrcdQ00LT2 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PrcdQ00LT2 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PrcdQ00LT2 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PrcdQ00LT2 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PrcdQ00LT2 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PrcdQ00LT2 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PrcdQ00LT2 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PrcdQ00LT2 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PrcdQ00LT2 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PrcdQ00LT2 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PrcdQ00LT2 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PrcdQ00LT2 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PrcdQ00LT2 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PrcdQ00LT2 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PrcdQ00LT2 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PrcdQ00LT2 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
PrcdQ00LT2 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PrcdQ00LT2 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
PrcdQ00LT2 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PrcdQ00LT2 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PrcdQ00LT2 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.6 ms