Protein–RNA interactions for Protein: Q00262

Stx2, Syntaxin-2, mousemouse

Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stx2Q00262 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
Stx2Q00262 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Stx2Q00262 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Stx2Q00262 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Stx2Q00262 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Stx2Q00262 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Stx2Q00262 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Stx2Q00262 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Stx2Q00262 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Stx2Q00262 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Stx2Q00262 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
Stx2Q00262 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Stx2Q00262 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Stx2Q00262 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Stx2Q00262 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Stx2Q00262 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Stx2Q00262 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Stx2Q00262 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Stx2Q00262 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Stx2Q00262 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Stx2Q00262 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Stx2Q00262 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Stx2Q00262 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Stx2Q00262 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Stx2Q00262 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
Stx2Q00262 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Stx2Q00262 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
Stx2Q00262 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Stx2Q00262 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Stx2Q00262 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Stx2Q00262 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
Stx2Q00262 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Stx2Q00262 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Stx2Q00262 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
Stx2Q00262 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Stx2Q00262 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Stx2Q00262 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Stx2Q00262 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Stx2Q00262 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Stx2Q00262 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Stx2Q00262 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Stx2Q00262 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Stx2Q00262 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Stx2Q00262 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Stx2Q00262 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Stx2Q00262 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Stx2Q00262 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Stx2Q00262 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Stx2Q00262 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Stx2Q00262 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Stx2Q00262 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Stx2Q00262 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Stx2Q00262 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Stx2Q00262 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Stx2Q00262 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Stx2Q00262 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Stx2Q00262 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Stx2Q00262 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Stx2Q00262 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Stx2Q00262 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Stx2Q00262 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Stx2Q00262 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Stx2Q00262 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Stx2Q00262 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Stx2Q00262 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Stx2Q00262 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Stx2Q00262 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
Stx2Q00262 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Stx2Q00262 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Stx2Q00262 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Stx2Q00262 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Stx2Q00262 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC25.39■■□□□ 1.65
Stx2Q00262 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Stx2Q00262 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
Stx2Q00262 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Stx2Q00262 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Stx2Q00262 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Stx2Q00262 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Stx2Q00262 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Stx2Q00262 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Stx2Q00262 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Stx2Q00262 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Stx2Q00262 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Stx2Q00262 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Stx2Q00262 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Stx2Q00262 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Stx2Q00262 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Stx2Q00262 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Stx2Q00262 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Stx2Q00262 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Stx2Q00262 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Stx2Q00262 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Stx2Q00262 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Stx2Q00262 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Stx2Q00262 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Stx2Q00262 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Stx2Q00262 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Stx2Q00262 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Stx2Q00262 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Stx2Q00262 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.9 ms