Protein–RNA interactions for Protein: P97858

Slc35b1, Solute carrier family 35 member B1, mousemouse

Predictions only

Length 322 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc35b1P97858 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Slc35b1P97858 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Slc35b1P97858 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Slc35b1P97858 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Slc35b1P97858 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Slc35b1P97858 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Slc35b1P97858 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Slc35b1P97858 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Slc35b1P97858 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Slc35b1P97858 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Slc35b1P97858 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Slc35b1P97858 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Slc35b1P97858 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Slc35b1P97858 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Slc35b1P97858 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Slc35b1P97858 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Slc35b1P97858 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Slc35b1P97858 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Slc35b1P97858 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Slc35b1P97858 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Slc35b1P97858 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Slc35b1P97858 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Slc35b1P97858 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Slc35b1P97858 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Slc35b1P97858 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Slc35b1P97858 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Slc35b1P97858 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Slc35b1P97858 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Slc35b1P97858 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Slc35b1P97858 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Slc35b1P97858 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Slc35b1P97858 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Slc35b1P97858 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Slc35b1P97858 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Slc35b1P97858 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Slc35b1P97858 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Slc35b1P97858 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Slc35b1P97858 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Slc35b1P97858 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Slc35b1P97858 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Slc35b1P97858 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Slc35b1P97858 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Slc35b1P97858 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Slc35b1P97858 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Slc35b1P97858 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Slc35b1P97858 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Slc35b1P97858 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Slc35b1P97858 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Slc35b1P97858 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Slc35b1P97858 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Slc35b1P97858 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Slc35b1P97858 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Slc35b1P97858 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Slc35b1P97858 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Slc35b1P97858 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Slc35b1P97858 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Slc35b1P97858 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Slc35b1P97858 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Slc35b1P97858 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Slc35b1P97858 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Slc35b1P97858 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Slc35b1P97858 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Slc35b1P97858 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Slc35b1P97858 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Slc35b1P97858 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Slc35b1P97858 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Slc35b1P97858 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Slc35b1P97858 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Slc35b1P97858 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Slc35b1P97858 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Slc35b1P97858 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Slc35b1P97858 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Slc35b1P97858 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Slc35b1P97858 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Slc35b1P97858 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Slc35b1P97858 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Slc35b1P97858 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Slc35b1P97858 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Slc35b1P97858 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Slc35b1P97858 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Slc35b1P97858 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Slc35b1P97858 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Slc35b1P97858 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Slc35b1P97858 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Slc35b1P97858 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Slc35b1P97858 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Slc35b1P97858 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Slc35b1P97858 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Slc35b1P97858 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Slc35b1P97858 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Slc35b1P97858 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Slc35b1P97858 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Slc35b1P97858 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Slc35b1P97858 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Slc35b1P97858 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Slc35b1P97858 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Slc35b1P97858 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Slc35b1P97858 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Slc35b1P97858 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Slc35b1P97858 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.6 ms