Protein–RNA interactions for Protein: P97797

Sirpa, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type substrate 1, mousemouse

Predictions only

Length 513 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SirpaP97797 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
SirpaP97797 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SirpaP97797 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SirpaP97797 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SirpaP97797 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SirpaP97797 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SirpaP97797 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SirpaP97797 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SirpaP97797 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SirpaP97797 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
SirpaP97797 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
SirpaP97797 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SirpaP97797 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SirpaP97797 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SirpaP97797 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SirpaP97797 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SirpaP97797 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SirpaP97797 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SirpaP97797 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SirpaP97797 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
SirpaP97797 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SirpaP97797 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
SirpaP97797 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SirpaP97797 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SirpaP97797 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SirpaP97797 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SirpaP97797 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SirpaP97797 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SirpaP97797 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SirpaP97797 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
SirpaP97797 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SirpaP97797 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SirpaP97797 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SirpaP97797 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SirpaP97797 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SirpaP97797 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SirpaP97797 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SirpaP97797 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SirpaP97797 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
SirpaP97797 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SirpaP97797 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SirpaP97797 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
SirpaP97797 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
SirpaP97797 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SirpaP97797 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SirpaP97797 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SirpaP97797 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SirpaP97797 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
SirpaP97797 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SirpaP97797 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SirpaP97797 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SirpaP97797 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
SirpaP97797 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SirpaP97797 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SirpaP97797 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SirpaP97797 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SirpaP97797 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SirpaP97797 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SirpaP97797 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
SirpaP97797 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SirpaP97797 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SirpaP97797 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SirpaP97797 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SirpaP97797 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SirpaP97797 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
SirpaP97797 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SirpaP97797 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SirpaP97797 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SirpaP97797 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SirpaP97797 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SirpaP97797 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SirpaP97797 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SirpaP97797 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SirpaP97797 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SirpaP97797 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SirpaP97797 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SirpaP97797 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SirpaP97797 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SirpaP97797 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
SirpaP97797 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SirpaP97797 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SirpaP97797 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SirpaP97797 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SirpaP97797 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SirpaP97797 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SirpaP97797 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
SirpaP97797 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SirpaP97797 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SirpaP97797 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SirpaP97797 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SirpaP97797 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SirpaP97797 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SirpaP97797 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
SirpaP97797 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SirpaP97797 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SirpaP97797 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SirpaP97797 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SirpaP97797 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SirpaP97797 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SirpaP97797 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.1 ms