Protein–RNA interactions for Protein: P97390

Vps45, Vacuolar protein sorting-associated protein 45, mousemouse

Predictions only

Length 570 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps45P97390 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Vps45P97390 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Vps45P97390 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Vps45P97390 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Vps45P97390 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Vps45P97390 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
Vps45P97390 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
Vps45P97390 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Vps45P97390 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Vps45P97390 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Vps45P97390 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
Vps45P97390 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Vps45P97390 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Vps45P97390 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Vps45P97390 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Vps45P97390 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Vps45P97390 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
Vps45P97390 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
Vps45P97390 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Vps45P97390 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Vps45P97390 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Vps45P97390 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Vps45P97390 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Vps45P97390 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Vps45P97390 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Vps45P97390 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.91
Vps45P97390 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Vps45P97390 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Vps45P97390 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Vps45P97390 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Vps45P97390 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Vps45P97390 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Vps45P97390 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Vps45P97390 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
Vps45P97390 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Vps45P97390 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
Vps45P97390 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Vps45P97390 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Vps45P97390 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Vps45P97390 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Vps45P97390 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Vps45P97390 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
Vps45P97390 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Vps45P97390 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Vps45P97390 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Vps45P97390 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Vps45P97390 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Vps45P97390 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Vps45P97390 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
Vps45P97390 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Vps45P97390 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Vps45P97390 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Vps45P97390 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Vps45P97390 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Vps45P97390 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Vps45P97390 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Vps45P97390 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Vps45P97390 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Vps45P97390 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Vps45P97390 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Vps45P97390 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Vps45P97390 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Vps45P97390 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Vps45P97390 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Vps45P97390 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Vps45P97390 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Vps45P97390 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Vps45P97390 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Vps45P97390 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Vps45P97390 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Vps45P97390 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Vps45P97390 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Vps45P97390 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Vps45P97390 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Vps45P97390 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Vps45P97390 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Vps45P97390 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Vps45P97390 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Vps45P97390 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
Vps45P97390 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Vps45P97390 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
Vps45P97390 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Vps45P97390 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Vps45P97390 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Vps45P97390 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Vps45P97390 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Vps45P97390 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Vps45P97390 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Vps45P97390 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Vps45P97390 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Vps45P97390 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Vps45P97390 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Vps45P97390 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Vps45P97390 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Vps45P97390 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Vps45P97390 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Vps45P97390 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Vps45P97390 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Vps45P97390 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Vps45P97390 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.1 ms