Protein–RNA interactions for Protein: P84751

Ig heavy chain Mem5 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P84751 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
P84751 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
P84751 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
P84751 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
P84751 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
P84751 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
P84751 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
P84751 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
P84751 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
P84751 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
P84751 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
P84751 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
P84751 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
P84751 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
P84751 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
P84751 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
P84751 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
P84751 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
P84751 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
P84751 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
P84751 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
P84751 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC18.52■□□□□ 0.55
P84751 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
P84751 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
P84751 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
P84751 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
P84751 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
P84751 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
P84751 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
P84751 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
P84751 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
P84751 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
P84751 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
P84751 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
P84751 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
P84751 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
P84751 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
P84751 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
P84751 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
P84751 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
P84751 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
P84751 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
P84751 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
P84751 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
P84751 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
P84751 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
P84751 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
P84751 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
P84751 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
P84751 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
P84751 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
P84751 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
P84751 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
P84751 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
P84751 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
P84751 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
P84751 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
P84751 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
P84751 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
P84751 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
P84751 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
P84751 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
P84751 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
P84751 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
P84751 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
P84751 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
P84751 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
P84751 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
P84751 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
P84751 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
P84751 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
P84751 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
P84751 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
P84751 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
P84751 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
P84751 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
P84751 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
P84751 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
P84751 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
P84751 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
P84751 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
P84751 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
P84751 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
P84751 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
P84751 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
P84751 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
P84751 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
P84751 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
P84751 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
P84751 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
P84751 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
P84751 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
P84751 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
P84751 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
P84751 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
P84751 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
P84751 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
P84751 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
P84751 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
P84751 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 86.6 ms