Protein–RNA interactions for Protein: P81069

Gabpb2, GA-binding protein subunit beta-2, mousemouse

Predictions only

Length 414 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabpb2P81069 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Gabpb2P81069 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
Gabpb2P81069 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
Gabpb2P81069 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Gabpb2P81069 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Gabpb2P81069 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Gabpb2P81069 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.2
Gabpb2P81069 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Gabpb2P81069 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Gabpb2P81069 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Gabpb2P81069 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Gabpb2P81069 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Gabpb2P81069 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Gabpb2P81069 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Gabpb2P81069 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Gabpb2P81069 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Gabpb2P81069 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Gabpb2P81069 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
Gabpb2P81069 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
Gabpb2P81069 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Gabpb2P81069 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
Gabpb2P81069 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Gabpb2P81069 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC28.71■■■□□ 2.19
Gabpb2P81069 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Gabpb2P81069 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Gabpb2P81069 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Gabpb2P81069 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Gabpb2P81069 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
Gabpb2P81069 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.17
Gabpb2P81069 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
Gabpb2P81069 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Gabpb2P81069 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Gabpb2P81069 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Gabpb2P81069 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
Gabpb2P81069 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Gabpb2P81069 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Gabpb2P81069 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Gabpb2P81069 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Gabpb2P81069 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Gabpb2P81069 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Gabpb2P81069 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Gabpb2P81069 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Gabpb2P81069 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC28.47■■■□□ 2.15
Gabpb2P81069 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Gabpb2P81069 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Gabpb2P81069 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
Gabpb2P81069 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Gabpb2P81069 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
Gabpb2P81069 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Gabpb2P81069 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Gabpb2P81069 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Gabpb2P81069 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Gabpb2P81069 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Gabpb2P81069 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
Gabpb2P81069 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
Gabpb2P81069 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Gabpb2P81069 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Gabpb2P81069 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC28.39■■■□□ 2.14
Gabpb2P81069 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
Gabpb2P81069 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Gabpb2P81069 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
Gabpb2P81069 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Gabpb2P81069 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Gabpb2P81069 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Gabpb2P81069 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Gabpb2P81069 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Gabpb2P81069 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Gabpb2P81069 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Gabpb2P81069 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Gabpb2P81069 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Gabpb2P81069 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Gabpb2P81069 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Gabpb2P81069 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Gabpb2P81069 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Gabpb2P81069 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Gabpb2P81069 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
Gabpb2P81069 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Gabpb2P81069 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Gabpb2P81069 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Gabpb2P81069 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Gabpb2P81069 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
Gabpb2P81069 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Gabpb2P81069 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Gabpb2P81069 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Gabpb2P81069 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Gabpb2P81069 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Gabpb2P81069 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Gabpb2P81069 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Gabpb2P81069 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Gabpb2P81069 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Gabpb2P81069 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Gabpb2P81069 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Gabpb2P81069 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Gabpb2P81069 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Gabpb2P81069 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Gabpb2P81069 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Gabpb2P81069 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
Gabpb2P81069 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Gabpb2P81069 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Gabpb2P81069 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.3 ms