Protein–RNA interactions for Protein: P70658

Cxcr4, C-X-C chemokine receptor type 4, mousemouse

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxcr4P70658 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Cxcr4P70658 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Cxcr4P70658 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Cxcr4P70658 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Cxcr4P70658 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Cxcr4P70658 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Cxcr4P70658 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Cxcr4P70658 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Cxcr4P70658 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Cxcr4P70658 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Cxcr4P70658 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Cxcr4P70658 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Cxcr4P70658 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Cxcr4P70658 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Cxcr4P70658 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Cxcr4P70658 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Cxcr4P70658 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Cxcr4P70658 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cxcr4P70658 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Cxcr4P70658 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Cxcr4P70658 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cxcr4P70658 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Cxcr4P70658 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cxcr4P70658 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cxcr4P70658 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Cxcr4P70658 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Cxcr4P70658 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cxcr4P70658 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cxcr4P70658 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Cxcr4P70658 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cxcr4P70658 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cxcr4P70658 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cxcr4P70658 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cxcr4P70658 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Cxcr4P70658 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Cxcr4P70658 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Cxcr4P70658 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Cxcr4P70658 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Cxcr4P70658 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Cxcr4P70658 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Cxcr4P70658 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Cxcr4P70658 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Cxcr4P70658 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Cxcr4P70658 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Cxcr4P70658 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Cxcr4P70658 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Cxcr4P70658 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Cxcr4P70658 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Cxcr4P70658 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Cxcr4P70658 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Cxcr4P70658 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Cxcr4P70658 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Cxcr4P70658 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Cxcr4P70658 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Cxcr4P70658 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Cxcr4P70658 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Cxcr4P70658 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Cxcr4P70658 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Cxcr4P70658 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Cxcr4P70658 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Cxcr4P70658 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Cxcr4P70658 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Cxcr4P70658 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Cxcr4P70658 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
Cxcr4P70658 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Cxcr4P70658 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Cxcr4P70658 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
Cxcr4P70658 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Cxcr4P70658 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Cxcr4P70658 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Cxcr4P70658 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Cxcr4P70658 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Cxcr4P70658 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Cxcr4P70658 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Cxcr4P70658 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Cxcr4P70658 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Cxcr4P70658 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Cxcr4P70658 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
Cxcr4P70658 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Cxcr4P70658 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Cxcr4P70658 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Cxcr4P70658 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Cxcr4P70658 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Cxcr4P70658 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Cxcr4P70658 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Cxcr4P70658 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Cxcr4P70658 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Cxcr4P70658 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Cxcr4P70658 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Cxcr4P70658 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Cxcr4P70658 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Cxcr4P70658 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Cxcr4P70658 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Cxcr4P70658 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Cxcr4P70658 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Cxcr4P70658 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Cxcr4P70658 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Cxcr4P70658 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Cxcr4P70658 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Cxcr4P70658 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.8 ms