Protein–RNA interactions for Protein: P70459

Erf, ETS domain-containing transcription factor ERF, mousemouse

Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ErfP70459 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ErfP70459 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ErfP70459 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ErfP70459 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ErfP70459 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ErfP70459 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ErfP70459 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ErfP70459 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ErfP70459 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ErfP70459 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ErfP70459 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ErfP70459 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ErfP70459 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ErfP70459 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ErfP70459 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ErfP70459 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ErfP70459 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ErfP70459 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ErfP70459 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
ErfP70459 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.35
ErfP70459 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ErfP70459 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ErfP70459 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
ErfP70459 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ErfP70459 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ErfP70459 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ErfP70459 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ErfP70459 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ErfP70459 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ErfP70459 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ErfP70459 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ErfP70459 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ErfP70459 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ErfP70459 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ErfP70459 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ErfP70459 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ErfP70459 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ErfP70459 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ErfP70459 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
ErfP70459 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ErfP70459 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ErfP70459 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ErfP70459 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ErfP70459 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
ErfP70459 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
ErfP70459 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
ErfP70459 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ErfP70459 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ErfP70459 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ErfP70459 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ErfP70459 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
ErfP70459 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ErfP70459 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ErfP70459 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ErfP70459 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
ErfP70459 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ErfP70459 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ErfP70459 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ErfP70459 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ErfP70459 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ErfP70459 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ErfP70459 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ErfP70459 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ErfP70459 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
ErfP70459 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ErfP70459 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ErfP70459 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ErfP70459 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ErfP70459 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ErfP70459 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
ErfP70459 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ErfP70459 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ErfP70459 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ErfP70459 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ErfP70459 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ErfP70459 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ErfP70459 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ErfP70459 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ErfP70459 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ErfP70459 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ErfP70459 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ErfP70459 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
ErfP70459 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ErfP70459 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ErfP70459 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
ErfP70459 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ErfP70459 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ErfP70459 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ErfP70459 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ErfP70459 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ErfP70459 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ErfP70459 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ErfP70459 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ErfP70459 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ErfP70459 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ErfP70459 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ErfP70459 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ErfP70459 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ErfP70459 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ErfP70459 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms