Protein–RNA interactions for Protein: P70122

Sbds, Ribosome maturation protein SBDS, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SbdsP70122 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SbdsP70122 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SbdsP70122 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
SbdsP70122 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
SbdsP70122 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SbdsP70122 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SbdsP70122 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
SbdsP70122 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SbdsP70122 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
SbdsP70122 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
SbdsP70122 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
SbdsP70122 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
SbdsP70122 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
SbdsP70122 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
SbdsP70122 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SbdsP70122 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
SbdsP70122 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
SbdsP70122 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
SbdsP70122 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SbdsP70122 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
SbdsP70122 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SbdsP70122 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
SbdsP70122 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SbdsP70122 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SbdsP70122 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SbdsP70122 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SbdsP70122 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SbdsP70122 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
SbdsP70122 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
SbdsP70122 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SbdsP70122 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SbdsP70122 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SbdsP70122 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
SbdsP70122 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
SbdsP70122 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
SbdsP70122 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SbdsP70122 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SbdsP70122 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
SbdsP70122 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SbdsP70122 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
SbdsP70122 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SbdsP70122 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
SbdsP70122 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SbdsP70122 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
SbdsP70122 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SbdsP70122 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
SbdsP70122 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SbdsP70122 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
SbdsP70122 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
SbdsP70122 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
SbdsP70122 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
SbdsP70122 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
SbdsP70122 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SbdsP70122 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
SbdsP70122 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SbdsP70122 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SbdsP70122 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SbdsP70122 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SbdsP70122 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
SbdsP70122 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SbdsP70122 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SbdsP70122 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC26.54■■□□□ 1.84
SbdsP70122 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SbdsP70122 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SbdsP70122 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
SbdsP70122 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
SbdsP70122 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
SbdsP70122 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC26.51■■□□□ 1.83
SbdsP70122 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
SbdsP70122 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SbdsP70122 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SbdsP70122 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SbdsP70122 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
SbdsP70122 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
SbdsP70122 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SbdsP70122 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SbdsP70122 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SbdsP70122 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SbdsP70122 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
SbdsP70122 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
SbdsP70122 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SbdsP70122 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
SbdsP70122 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
SbdsP70122 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SbdsP70122 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
SbdsP70122 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SbdsP70122 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
SbdsP70122 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC26.36■■□□□ 1.81
SbdsP70122 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
SbdsP70122 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
SbdsP70122 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
SbdsP70122 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SbdsP70122 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SbdsP70122 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SbdsP70122 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
SbdsP70122 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
SbdsP70122 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
SbdsP70122 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SbdsP70122 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SbdsP70122 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms