Protein–RNA interactions for Protein: P63089

Ptn, Pleiotrophin, mousemouse

Predictions only

Length 168 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtnP63089 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PtnP63089 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PtnP63089 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PtnP63089 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PtnP63089 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PtnP63089 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PtnP63089 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PtnP63089 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
PtnP63089 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PtnP63089 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
PtnP63089 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
PtnP63089 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PtnP63089 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PtnP63089 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PtnP63089 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PtnP63089 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PtnP63089 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PtnP63089 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PtnP63089 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PtnP63089 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PtnP63089 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PtnP63089 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PtnP63089 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PtnP63089 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PtnP63089 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PtnP63089 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PtnP63089 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PtnP63089 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PtnP63089 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PtnP63089 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PtnP63089 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PtnP63089 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
PtnP63089 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PtnP63089 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PtnP63089 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PtnP63089 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PtnP63089 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PtnP63089 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PtnP63089 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PtnP63089 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PtnP63089 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PtnP63089 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PtnP63089 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PtnP63089 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PtnP63089 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
PtnP63089 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PtnP63089 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PtnP63089 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PtnP63089 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PtnP63089 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PtnP63089 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PtnP63089 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PtnP63089 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PtnP63089 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PtnP63089 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PtnP63089 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PtnP63089 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PtnP63089 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PtnP63089 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PtnP63089 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PtnP63089 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PtnP63089 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PtnP63089 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PtnP63089 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PtnP63089 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PtnP63089 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PtnP63089 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PtnP63089 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PtnP63089 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PtnP63089 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PtnP63089 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PtnP63089 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PtnP63089 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PtnP63089 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PtnP63089 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PtnP63089 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PtnP63089 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PtnP63089 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PtnP63089 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PtnP63089 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PtnP63089 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PtnP63089 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PtnP63089 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PtnP63089 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PtnP63089 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PtnP63089 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PtnP63089 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PtnP63089 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PtnP63089 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PtnP63089 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PtnP63089 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PtnP63089 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PtnP63089 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PtnP63089 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PtnP63089 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
PtnP63089 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PtnP63089 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
PtnP63089 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PtnP63089 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PtnP63089 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.5 ms