Protein–RNA interactions for Protein: P62838

Ube2d2, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 D2, mousemouse

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2d2P62838 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ube2d2P62838 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Ube2d2P62838 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ube2d2P62838 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ube2d2P62838 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Ube2d2P62838 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ube2d2P62838 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ube2d2P62838 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ube2d2P62838 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ube2d2P62838 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ube2d2P62838 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ube2d2P62838 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ube2d2P62838 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Ube2d2P62838 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ube2d2P62838 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ube2d2P62838 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ube2d2P62838 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ube2d2P62838 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ube2d2P62838 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ube2d2P62838 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ube2d2P62838 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ube2d2P62838 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ube2d2P62838 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ube2d2P62838 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ube2d2P62838 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ube2d2P62838 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ube2d2P62838 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ube2d2P62838 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ube2d2P62838 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ube2d2P62838 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ube2d2P62838 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ube2d2P62838 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ube2d2P62838 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ube2d2P62838 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ube2d2P62838 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ube2d2P62838 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ube2d2P62838 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Ube2d2P62838 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ube2d2P62838 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ube2d2P62838 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ube2d2P62838 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ube2d2P62838 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ube2d2P62838 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ube2d2P62838 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ube2d2P62838 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Ube2d2P62838 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Ube2d2P62838 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ube2d2P62838 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ube2d2P62838 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ube2d2P62838 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Ube2d2P62838 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ube2d2P62838 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ube2d2P62838 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ube2d2P62838 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ube2d2P62838 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ube2d2P62838 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ube2d2P62838 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ube2d2P62838 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ube2d2P62838 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Ube2d2P62838 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ube2d2P62838 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ube2d2P62838 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ube2d2P62838 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Ube2d2P62838 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Ube2d2P62838 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ube2d2P62838 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ube2d2P62838 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ube2d2P62838 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ube2d2P62838 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ube2d2P62838 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ube2d2P62838 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ube2d2P62838 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ube2d2P62838 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ube2d2P62838 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ube2d2P62838 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ube2d2P62838 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ube2d2P62838 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ube2d2P62838 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ube2d2P62838 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ube2d2P62838 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ube2d2P62838 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ube2d2P62838 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ube2d2P62838 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ube2d2P62838 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ube2d2P62838 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ube2d2P62838 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ube2d2P62838 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ube2d2P62838 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ube2d2P62838 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ube2d2P62838 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ube2d2P62838 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Ube2d2P62838 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ube2d2P62838 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ube2d2P62838 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ube2d2P62838 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ube2d2P62838 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ube2d2P62838 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ube2d2P62838 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ube2d2P62838 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ube2d2P62838 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.3 ms