Protein–RNA interactions for Protein: P61211

Arl1, ADP-ribosylation factor-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arl1P61211 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Arl1P61211 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Arl1P61211 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Arl1P61211 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Arl1P61211 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Arl1P61211 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Arl1P61211 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Arl1P61211 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Arl1P61211 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Arl1P61211 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Arl1P61211 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Arl1P61211 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Arl1P61211 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Arl1P61211 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Arl1P61211 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
Arl1P61211 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Arl1P61211 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Arl1P61211 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Arl1P61211 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Arl1P61211 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Arl1P61211 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Arl1P61211 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Arl1P61211 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Arl1P61211 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
Arl1P61211 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Arl1P61211 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Arl1P61211 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Arl1P61211 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Arl1P61211 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
Arl1P61211 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Arl1P61211 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Arl1P61211 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Arl1P61211 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
Arl1P61211 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Arl1P61211 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Arl1P61211 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Arl1P61211 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Arl1P61211 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Arl1P61211 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Arl1P61211 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Arl1P61211 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Arl1P61211 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Arl1P61211 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Arl1P61211 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Arl1P61211 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Arl1P61211 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Arl1P61211 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Arl1P61211 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Arl1P61211 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Arl1P61211 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Arl1P61211 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Arl1P61211 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Arl1P61211 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.6
Arl1P61211 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Arl1P61211 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Arl1P61211 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Arl1P61211 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Arl1P61211 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
Arl1P61211 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Arl1P61211 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Arl1P61211 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Arl1P61211 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Arl1P61211 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Arl1P61211 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC25■■□□□ 1.59
Arl1P61211 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Arl1P61211 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Arl1P61211 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Arl1P61211 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Arl1P61211 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Arl1P61211 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Arl1P61211 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Arl1P61211 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
Arl1P61211 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Arl1P61211 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Arl1P61211 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Arl1P61211 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Arl1P61211 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Arl1P61211 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Arl1P61211 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Arl1P61211 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Arl1P61211 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Arl1P61211 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Arl1P61211 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Arl1P61211 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Arl1P61211 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Arl1P61211 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Arl1P61211 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Arl1P61211 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Arl1P61211 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Arl1P61211 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Arl1P61211 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Arl1P61211 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Arl1P61211 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Arl1P61211 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
Arl1P61211 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Arl1P61211 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Arl1P61211 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Arl1P61211 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Arl1P61211 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Arl1P61211 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.3 ms