Protein–RNA interactions for Protein: P61211

Arl1, ADP-ribosylation factor-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arl1P61211 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC25,52■■□□□ 1,68
Arl1P61211 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,51■■□□□ 1,67
Arl1P61211 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,51■■□□□ 1,67
Arl1P61211 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,51■■□□□ 1,67
Arl1P61211 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,5■■□□□ 1,67
Arl1P61211 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25,5■■□□□ 1,67
Arl1P61211 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,49■■□□□ 1,67
Arl1P61211 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC25,44■■□□□ 1,66
Arl1P61211 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,44■■□□□ 1,66
Arl1P61211 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,43■■□□□ 1,66
Arl1P61211 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC25,43■■□□□ 1,66
Arl1P61211 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC25,4■■□□□ 1,66
Arl1P61211 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25,4■■□□□ 1,66
Arl1P61211 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC25,39■■□□□ 1,66
Arl1P61211 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC25,39■■□□□ 1,66
Arl1P61211 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25,38■■□□□ 1,65
Arl1P61211 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25,38■■□□□ 1,65
Arl1P61211 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC25,37■■□□□ 1,65
Arl1P61211 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,36■■□□□ 1,65
Arl1P61211 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,36■■□□□ 1,65
Arl1P61211 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25,36■■□□□ 1,65
Arl1P61211 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,35■■□□□ 1,65
Arl1P61211 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25,34■■□□□ 1,65
Arl1P61211 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC25,32■■□□□ 1,64
Arl1P61211 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,32■■□□□ 1,64
Arl1P61211 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC25,31■■□□□ 1,64
Arl1P61211 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,29■■□□□ 1,64
Arl1P61211 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,29■■□□□ 1,64
Arl1P61211 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC25,29■■□□□ 1,64
Arl1P61211 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,29■■□□□ 1,64
Arl1P61211 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,25■■□□□ 1,63
Arl1P61211 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25,25■■□□□ 1,63
Arl1P61211 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC25,25■■□□□ 1,63
Arl1P61211 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,22■■□□□ 1,63
Arl1P61211 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,2■■□□□ 1,63
Arl1P61211 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC25,19■■□□□ 1,62
Arl1P61211 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC25,19■■□□□ 1,62
Arl1P61211 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25,19■■□□□ 1,62
Arl1P61211 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC25,17■■□□□ 1,62
Arl1P61211 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25,16■■□□□ 1,62
Arl1P61211 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC25,15■■□□□ 1,62
Arl1P61211 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,14■■□□□ 1,61
Arl1P61211 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,12■■□□□ 1,61
Arl1P61211 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC25,12■■□□□ 1,61
Arl1P61211 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,11■■□□□ 1,61
Arl1P61211 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC25,11■■□□□ 1,61
Arl1P61211 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25,1■■□□□ 1,61
Arl1P61211 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,1■■□□□ 1,61
Arl1P61211 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,1■■□□□ 1,61
Arl1P61211 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,1■■□□□ 1,61
Arl1P61211 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25,09■■□□□ 1,61
Arl1P61211 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,09■■□□□ 1,61
Arl1P61211 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC25,08■■□□□ 1,6
Arl1P61211 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25,07■■□□□ 1,6
Arl1P61211 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,06■■□□□ 1,6
Arl1P61211 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC25,06■■□□□ 1,6
Arl1P61211 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25,06■■□□□ 1,6
Arl1P61211 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC25,05■■□□□ 1,6
Arl1P61211 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,03■■□□□ 1,6
Arl1P61211 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,03■■□□□ 1,6
Arl1P61211 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25,02■■□□□ 1,6
Arl1P61211 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC25,02■■□□□ 1,6
Arl1P61211 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1,59
Arl1P61211 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC25■■□□□ 1,59
Arl1P61211 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1,59
Arl1P61211 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1,59
Arl1P61211 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24,99■■□□□ 1,59
Arl1P61211 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC24,98■■□□□ 1,59
Arl1P61211 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,98■■□□□ 1,59
Arl1P61211 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,98■■□□□ 1,59
Arl1P61211 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,98■■□□□ 1,59
Arl1P61211 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC24,97■■□□□ 1,59
Arl1P61211 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,96■■□□□ 1,59
Arl1P61211 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,96■■□□□ 1,59
Arl1P61211 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,94■■□□□ 1,58
Arl1P61211 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24,93■■□□□ 1,58
Arl1P61211 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,92■■□□□ 1,58
Arl1P61211 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,92■■□□□ 1,58
Arl1P61211 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,91■■□□□ 1,58
Arl1P61211 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24,9■■□□□ 1,58
Arl1P61211 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,9■■□□□ 1,58
Arl1P61211 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC24,9■■□□□ 1,58
Arl1P61211 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,88■■□□□ 1,57
Arl1P61211 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,87■■□□□ 1,57
Arl1P61211 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,86■■□□□ 1,57
Arl1P61211 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,86■■□□□ 1,57
Arl1P61211 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,86■■□□□ 1,57
Arl1P61211 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC24,86■■□□□ 1,57
Arl1P61211 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,85■■□□□ 1,57
Arl1P61211 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC24,85■■□□□ 1,57
Arl1P61211 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,85■■□□□ 1,57
Arl1P61211 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,83■■□□□ 1,57
Arl1P61211 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24,83■■□□□ 1,57
Arl1P61211 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC24,82■■□□□ 1,56
Arl1P61211 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,81■■□□□ 1,56
Arl1P61211 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,81■■□□□ 1,56
Arl1P61211 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,81■■□□□ 1,56
Arl1P61211 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,8■■□□□ 1,56
Arl1P61211 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24,79■■□□□ 1,56
Arl1P61211 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,77■■□□□ 1,56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11,8 ms