Protein–RNA interactions for Protein: P61022

Chp1, Calcineurin B homologous protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 195 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chp1P61022 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Chp1P61022 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Chp1P61022 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Chp1P61022 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Chp1P61022 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Chp1P61022 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Chp1P61022 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Chp1P61022 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Chp1P61022 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Chp1P61022 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Chp1P61022 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Chp1P61022 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Chp1P61022 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
Chp1P61022 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Chp1P61022 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
Chp1P61022 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Chp1P61022 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Chp1P61022 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Chp1P61022 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Chp1P61022 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Chp1P61022 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Chp1P61022 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Chp1P61022 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Chp1P61022 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Chp1P61022 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Chp1P61022 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Chp1P61022 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
Chp1P61022 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
Chp1P61022 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Chp1P61022 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Chp1P61022 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Chp1P61022 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Chp1P61022 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Chp1P61022 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Chp1P61022 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Chp1P61022 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Chp1P61022 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
Chp1P61022 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Chp1P61022 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Chp1P61022 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Chp1P61022 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
Chp1P61022 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
Chp1P61022 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Chp1P61022 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Chp1P61022 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Chp1P61022 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Chp1P61022 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Chp1P61022 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Chp1P61022 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
Chp1P61022 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Chp1P61022 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
Chp1P61022 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Chp1P61022 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Chp1P61022 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
Chp1P61022 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Chp1P61022 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Chp1P61022 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Chp1P61022 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Chp1P61022 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Chp1P61022 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Chp1P61022 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Chp1P61022 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Chp1P61022 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Chp1P61022 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Chp1P61022 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Chp1P61022 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Chp1P61022 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Chp1P61022 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Chp1P61022 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Chp1P61022 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Chp1P61022 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Chp1P61022 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Chp1P61022 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Chp1P61022 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Chp1P61022 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
Chp1P61022 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Chp1P61022 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Chp1P61022 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Chp1P61022 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
Chp1P61022 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Chp1P61022 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Chp1P61022 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Chp1P61022 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Chp1P61022 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
Chp1P61022 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Chp1P61022 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Chp1P61022 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Chp1P61022 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
Chp1P61022 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
Chp1P61022 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Chp1P61022 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Chp1P61022 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Chp1P61022 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Chp1P61022 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Chp1P61022 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
Chp1P61022 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Chp1P61022 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Chp1P61022 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Chp1P61022 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Chp1P61022 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.6 ms