Protein–RNA interactions for Protein: P59913

Pcmtd1, Protein-L-isoaspartate O-methyltransferase domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 357 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcmtd1P59913 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Pcmtd1P59913 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
Pcmtd1P59913 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
Pcmtd1P59913 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Pcmtd1P59913 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Pcmtd1P59913 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Pcmtd1P59913 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Pcmtd1P59913 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
Pcmtd1P59913 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Pcmtd1P59913 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Pcmtd1P59913 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Pcmtd1P59913 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Pcmtd1P59913 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC29.73■■■□□ 2.35
Pcmtd1P59913 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
Pcmtd1P59913 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Pcmtd1P59913 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Pcmtd1P59913 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
Pcmtd1P59913 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
Pcmtd1P59913 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC29.69■■■□□ 2.34
Pcmtd1P59913 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Pcmtd1P59913 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Pcmtd1P59913 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC29.67■■■□□ 2.34
Pcmtd1P59913 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
Pcmtd1P59913 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
Pcmtd1P59913 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
Pcmtd1P59913 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC29.64■■■□□ 2.33
Pcmtd1P59913 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Pcmtd1P59913 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Pcmtd1P59913 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
Pcmtd1P59913 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Pcmtd1P59913 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Pcmtd1P59913 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Pcmtd1P59913 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC29.56■■■□□ 2.32
Pcmtd1P59913 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Pcmtd1P59913 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Pcmtd1P59913 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC29.55■■■□□ 2.32
Pcmtd1P59913 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
Pcmtd1P59913 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
Pcmtd1P59913 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Pcmtd1P59913 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Pcmtd1P59913 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC29.5■■■□□ 2.31
Pcmtd1P59913 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC29.49■■■□□ 2.31
Pcmtd1P59913 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Pcmtd1P59913 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Pcmtd1P59913 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
Pcmtd1P59913 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Pcmtd1P59913 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Pcmtd1P59913 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Pcmtd1P59913 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Pcmtd1P59913 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Pcmtd1P59913 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Pcmtd1P59913 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Pcmtd1P59913 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
Pcmtd1P59913 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Pcmtd1P59913 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Pcmtd1P59913 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
Pcmtd1P59913 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Pcmtd1P59913 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Pcmtd1P59913 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC29.37■■■□□ 2.29
Pcmtd1P59913 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Pcmtd1P59913 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
Pcmtd1P59913 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
Pcmtd1P59913 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC29.35■■■□□ 2.29
Pcmtd1P59913 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Pcmtd1P59913 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Pcmtd1P59913 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
Pcmtd1P59913 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
Pcmtd1P59913 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Pcmtd1P59913 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Pcmtd1P59913 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Pcmtd1P59913 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Pcmtd1P59913 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
Pcmtd1P59913 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Pcmtd1P59913 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Pcmtd1P59913 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Pcmtd1P59913 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Pcmtd1P59913 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Pcmtd1P59913 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
Pcmtd1P59913 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Pcmtd1P59913 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Pcmtd1P59913 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Pcmtd1P59913 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Pcmtd1P59913 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Pcmtd1P59913 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Pcmtd1P59913 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Pcmtd1P59913 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Pcmtd1P59913 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Pcmtd1P59913 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
Pcmtd1P59913 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
Pcmtd1P59913 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Pcmtd1P59913 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Pcmtd1P59913 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Pcmtd1P59913 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
Pcmtd1P59913 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Pcmtd1P59913 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Pcmtd1P59913 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Pcmtd1P59913 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Pcmtd1P59913 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
Pcmtd1P59913 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
Pcmtd1P59913 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.5 ms