Protein–RNA interactions for Protein: P59242

Cgn, Cingulin, mousemouse

Predictions only

Length 1,191 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CgnP59242 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC30.36■■■□□ 2.45
CgnP59242 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
CgnP59242 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
CgnP59242 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
CgnP59242 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
CgnP59242 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC30.31■■■□□ 2.44
CgnP59242 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC30.3■■■□□ 2.44
CgnP59242 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC30.27■■■□□ 2.44
CgnP59242 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
CgnP59242 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
CgnP59242 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.23■■■□□ 2.43
CgnP59242 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
CgnP59242 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
CgnP59242 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
CgnP59242 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
CgnP59242 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC30.2■■■□□ 2.43
CgnP59242 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.2■■■□□ 2.42
CgnP59242 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
CgnP59242 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC30.18■■■□□ 2.42
CgnP59242 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC30.17■■■□□ 2.42
CgnP59242 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.17■■■□□ 2.42
CgnP59242 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
CgnP59242 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC30.1■■■□□ 2.41
CgnP59242 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.1■■■□□ 2.41
CgnP59242 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
CgnP59242 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
CgnP59242 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
CgnP59242 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
CgnP59242 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
CgnP59242 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
CgnP59242 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
CgnP59242 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
CgnP59242 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.97■■■□□ 2.39
CgnP59242 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC29.97■■■□□ 2.39
CgnP59242 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
CgnP59242 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
CgnP59242 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC29.95■■■□□ 2.39
CgnP59242 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC29.95■■■□□ 2.38
CgnP59242 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
CgnP59242 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
CgnP59242 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
CgnP59242 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
CgnP59242 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
CgnP59242 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
CgnP59242 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
CgnP59242 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
CgnP59242 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
CgnP59242 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
CgnP59242 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
CgnP59242 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
CgnP59242 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
CgnP59242 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC29.86■■■□□ 2.37
CgnP59242 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
CgnP59242 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
CgnP59242 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
CgnP59242 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
CgnP59242 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
CgnP59242 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
CgnP59242 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
CgnP59242 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.36
CgnP59242 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
CgnP59242 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
CgnP59242 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
CgnP59242 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
CgnP59242 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
CgnP59242 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
CgnP59242 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
CgnP59242 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC29.71■■■□□ 2.35
CgnP59242 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
CgnP59242 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
CgnP59242 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
CgnP59242 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
CgnP59242 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
CgnP59242 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
CgnP59242 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
CgnP59242 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
CgnP59242 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
CgnP59242 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
CgnP59242 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
CgnP59242 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
CgnP59242 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
CgnP59242 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC29.58■■■□□ 2.33
CgnP59242 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
CgnP59242 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
CgnP59242 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
CgnP59242 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC29.53■■■□□ 2.32
CgnP59242 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
CgnP59242 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
CgnP59242 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
CgnP59242 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
CgnP59242 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
CgnP59242 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
CgnP59242 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
CgnP59242 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC29.48■■■□□ 2.31
CgnP59242 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
CgnP59242 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC29.48■■■□□ 2.31
CgnP59242 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
CgnP59242 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
CgnP59242 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
CgnP59242 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.4 ms