Protein–RNA interactions for Protein: P55292

Dsc2, Desmocollin-2, mousemouse

Predictions only

Length 902 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsc2P55292 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Dsc2P55292 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Dsc2P55292 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Dsc2P55292 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Dsc2P55292 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Dsc2P55292 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Dsc2P55292 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Dsc2P55292 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Dsc2P55292 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Dsc2P55292 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Dsc2P55292 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Dsc2P55292 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
Dsc2P55292 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Dsc2P55292 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Dsc2P55292 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Dsc2P55292 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Dsc2P55292 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Dsc2P55292 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Dsc2P55292 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Dsc2P55292 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Dsc2P55292 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
Dsc2P55292 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Dsc2P55292 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Dsc2P55292 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Dsc2P55292 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Dsc2P55292 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Dsc2P55292 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Dsc2P55292 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Dsc2P55292 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Dsc2P55292 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Dsc2P55292 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Dsc2P55292 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Dsc2P55292 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Dsc2P55292 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Dsc2P55292 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Dsc2P55292 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Dsc2P55292 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Dsc2P55292 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Dsc2P55292 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Dsc2P55292 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
Dsc2P55292 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Dsc2P55292 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Dsc2P55292 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Dsc2P55292 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Dsc2P55292 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Dsc2P55292 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Dsc2P55292 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Dsc2P55292 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Dsc2P55292 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Dsc2P55292 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Dsc2P55292 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Dsc2P55292 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Dsc2P55292 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Dsc2P55292 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Dsc2P55292 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Dsc2P55292 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Dsc2P55292 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Dsc2P55292 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Dsc2P55292 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Dsc2P55292 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Dsc2P55292 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Dsc2P55292 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Dsc2P55292 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Dsc2P55292 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Dsc2P55292 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Dsc2P55292 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Dsc2P55292 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Dsc2P55292 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Dsc2P55292 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Dsc2P55292 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Dsc2P55292 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Dsc2P55292 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Dsc2P55292 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Dsc2P55292 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Dsc2P55292 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Dsc2P55292 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Dsc2P55292 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Dsc2P55292 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Dsc2P55292 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Dsc2P55292 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Dsc2P55292 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Dsc2P55292 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
Dsc2P55292 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Dsc2P55292 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Dsc2P55292 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Dsc2P55292 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Dsc2P55292 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Dsc2P55292 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Dsc2P55292 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Dsc2P55292 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Dsc2P55292 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Dsc2P55292 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Dsc2P55292 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Dsc2P55292 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Dsc2P55292 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Dsc2P55292 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Dsc2P55292 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Dsc2P55292 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Dsc2P55292 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Dsc2P55292 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms