Protein–RNA interactions for Protein: P52787

Gif, Gastric intrinsic factor, mousemouse

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GifP52787 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GifP52787 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GifP52787 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
GifP52787 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
GifP52787 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GifP52787 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
GifP52787 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GifP52787 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GifP52787 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
GifP52787 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GifP52787 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GifP52787 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GifP52787 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
GifP52787 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GifP52787 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
GifP52787 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GifP52787 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GifP52787 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GifP52787 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GifP52787 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GifP52787 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GifP52787 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GifP52787 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
GifP52787 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
GifP52787 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GifP52787 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
GifP52787 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
GifP52787 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
GifP52787 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GifP52787 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GifP52787 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GifP52787 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GifP52787 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GifP52787 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GifP52787 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
GifP52787 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
GifP52787 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GifP52787 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GifP52787 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
GifP52787 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
GifP52787 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GifP52787 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
GifP52787 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
GifP52787 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GifP52787 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GifP52787 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GifP52787 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
GifP52787 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GifP52787 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
GifP52787 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GifP52787 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GifP52787 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GifP52787 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GifP52787 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GifP52787 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GifP52787 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
GifP52787 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
GifP52787 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
GifP52787 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
GifP52787 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GifP52787 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GifP52787 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GifP52787 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GifP52787 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GifP52787 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GifP52787 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GifP52787 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GifP52787 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GifP52787 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GifP52787 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GifP52787 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GifP52787 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GifP52787 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GifP52787 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GifP52787 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GifP52787 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GifP52787 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GifP52787 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GifP52787 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GifP52787 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GifP52787 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GifP52787 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GifP52787 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
GifP52787 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
GifP52787 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
GifP52787 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GifP52787 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
GifP52787 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GifP52787 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GifP52787 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
GifP52787 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
GifP52787 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GifP52787 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GifP52787 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GifP52787 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GifP52787 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
GifP52787 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
GifP52787 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GifP52787 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
GifP52787 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.1 ms