Protein–RNA interactions for Protein: P48031

Gbx2, Homeobox protein GBX-2, mousemouse

Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbx2P48031 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Gbx2P48031 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Gbx2P48031 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Gbx2P48031 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Gbx2P48031 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Gbx2P48031 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Gbx2P48031 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Gbx2P48031 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Gbx2P48031 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Gbx2P48031 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Gbx2P48031 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Gbx2P48031 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Gbx2P48031 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Gbx2P48031 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Gbx2P48031 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Gbx2P48031 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Gbx2P48031 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Gbx2P48031 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Gbx2P48031 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Gbx2P48031 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Gbx2P48031 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Gbx2P48031 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Gbx2P48031 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Gbx2P48031 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Gbx2P48031 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Gbx2P48031 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Gbx2P48031 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Gbx2P48031 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Gbx2P48031 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Gbx2P48031 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Gbx2P48031 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Gbx2P48031 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Gbx2P48031 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Gbx2P48031 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Gbx2P48031 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
Gbx2P48031 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Gbx2P48031 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Gbx2P48031 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Gbx2P48031 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Gbx2P48031 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Gbx2P48031 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Gbx2P48031 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Gbx2P48031 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Gbx2P48031 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Gbx2P48031 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Gbx2P48031 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Gbx2P48031 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Gbx2P48031 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Gbx2P48031 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Gbx2P48031 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Gbx2P48031 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Gbx2P48031 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Gbx2P48031 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
Gbx2P48031 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Gbx2P48031 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
Gbx2P48031 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Gbx2P48031 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Gbx2P48031 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Gbx2P48031 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Gbx2P48031 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Gbx2P48031 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Gbx2P48031 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Gbx2P48031 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Gbx2P48031 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Gbx2P48031 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Gbx2P48031 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Gbx2P48031 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Gbx2P48031 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Gbx2P48031 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Gbx2P48031 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Gbx2P48031 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Gbx2P48031 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Gbx2P48031 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Gbx2P48031 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Gbx2P48031 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Gbx2P48031 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Gbx2P48031 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Gbx2P48031 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Gbx2P48031 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Gbx2P48031 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Gbx2P48031 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Gbx2P48031 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Gbx2P48031 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Gbx2P48031 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Gbx2P48031 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Gbx2P48031 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Gbx2P48031 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Gbx2P48031 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Gbx2P48031 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Gbx2P48031 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Gbx2P48031 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Gbx2P48031 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Gbx2P48031 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Gbx2P48031 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Gbx2P48031 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Gbx2P48031 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Gbx2P48031 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Gbx2P48031 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Gbx2P48031 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Gbx2P48031 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.8 ms