Protein–RNA interactions for Protein: P47239

Pax7, Paired box protein Pax-7, mousemouse

Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pax7P47239 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Pax7P47239 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Pax7P47239 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Pax7P47239 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Pax7P47239 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Pax7P47239 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Pax7P47239 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Pax7P47239 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Pax7P47239 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Pax7P47239 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Pax7P47239 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Pax7P47239 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Pax7P47239 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Pax7P47239 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Pax7P47239 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Pax7P47239 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Pax7P47239 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Pax7P47239 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Pax7P47239 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Pax7P47239 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Pax7P47239 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Pax7P47239 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Pax7P47239 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Pax7P47239 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Pax7P47239 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Pax7P47239 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Pax7P47239 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Pax7P47239 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Pax7P47239 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Pax7P47239 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Pax7P47239 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Pax7P47239 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Pax7P47239 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Pax7P47239 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Pax7P47239 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Pax7P47239 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Pax7P47239 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Pax7P47239 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Pax7P47239 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Pax7P47239 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Pax7P47239 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Pax7P47239 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Pax7P47239 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Pax7P47239 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Pax7P47239 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Pax7P47239 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Pax7P47239 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Pax7P47239 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Pax7P47239 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Pax7P47239 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Pax7P47239 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Pax7P47239 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Pax7P47239 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Pax7P47239 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Pax7P47239 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Pax7P47239 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Pax7P47239 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Pax7P47239 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Pax7P47239 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Pax7P47239 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Pax7P47239 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Pax7P47239 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Pax7P47239 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Pax7P47239 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Pax7P47239 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
Pax7P47239 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Pax7P47239 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Pax7P47239 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Pax7P47239 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Pax7P47239 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Pax7P47239 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Pax7P47239 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Pax7P47239 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Pax7P47239 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Pax7P47239 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Pax7P47239 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Pax7P47239 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Pax7P47239 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Pax7P47239 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Pax7P47239 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Pax7P47239 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Pax7P47239 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Pax7P47239 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Pax7P47239 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Pax7P47239 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Pax7P47239 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Pax7P47239 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Pax7P47239 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Pax7P47239 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Pax7P47239 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Pax7P47239 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Pax7P47239 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Pax7P47239 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Pax7P47239 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Pax7P47239 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
Pax7P47239 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Pax7P47239 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Pax7P47239 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Pax7P47239 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Pax7P47239 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.7 ms