Protein–RNA interactions for Protein: P43488

Tnfsf4, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 4, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsf4P43488 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Tnfsf4P43488 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Tnfsf4P43488 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Tnfsf4P43488 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
Tnfsf4P43488 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Tnfsf4P43488 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Tnfsf4P43488 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Tnfsf4P43488 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
Tnfsf4P43488 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Tnfsf4P43488 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Tnfsf4P43488 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Tnfsf4P43488 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Tnfsf4P43488 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Tnfsf4P43488 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Tnfsf4P43488 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Tnfsf4P43488 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Tnfsf4P43488 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Tnfsf4P43488 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Tnfsf4P43488 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Tnfsf4P43488 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Tnfsf4P43488 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Tnfsf4P43488 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Tnfsf4P43488 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Tnfsf4P43488 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Tnfsf4P43488 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Tnfsf4P43488 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Tnfsf4P43488 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Tnfsf4P43488 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Tnfsf4P43488 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Tnfsf4P43488 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Tnfsf4P43488 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Tnfsf4P43488 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Tnfsf4P43488 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Tnfsf4P43488 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Tnfsf4P43488 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Tnfsf4P43488 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Tnfsf4P43488 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Tnfsf4P43488 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Tnfsf4P43488 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Tnfsf4P43488 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Tnfsf4P43488 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Tnfsf4P43488 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Tnfsf4P43488 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Tnfsf4P43488 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Tnfsf4P43488 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Tnfsf4P43488 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Tnfsf4P43488 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Tnfsf4P43488 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Tnfsf4P43488 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Tnfsf4P43488 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Tnfsf4P43488 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Tnfsf4P43488 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
Tnfsf4P43488 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
Tnfsf4P43488 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Tnfsf4P43488 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Tnfsf4P43488 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Tnfsf4P43488 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Tnfsf4P43488 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
Tnfsf4P43488 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
Tnfsf4P43488 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Tnfsf4P43488 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Tnfsf4P43488 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Tnfsf4P43488 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Tnfsf4P43488 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Tnfsf4P43488 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Tnfsf4P43488 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Tnfsf4P43488 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Tnfsf4P43488 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
Tnfsf4P43488 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Tnfsf4P43488 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Tnfsf4P43488 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Tnfsf4P43488 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Tnfsf4P43488 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Tnfsf4P43488 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Tnfsf4P43488 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Tnfsf4P43488 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Tnfsf4P43488 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Tnfsf4P43488 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Tnfsf4P43488 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Tnfsf4P43488 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Tnfsf4P43488 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Tnfsf4P43488 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Tnfsf4P43488 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Tnfsf4P43488 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Tnfsf4P43488 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Tnfsf4P43488 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Tnfsf4P43488 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Tnfsf4P43488 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Tnfsf4P43488 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Tnfsf4P43488 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Tnfsf4P43488 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Tnfsf4P43488 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Tnfsf4P43488 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.51
Tnfsf4P43488 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Tnfsf4P43488 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Tnfsf4P43488 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Tnfsf4P43488 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Tnfsf4P43488 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Tnfsf4P43488 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Tnfsf4P43488 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.4 ms