Protein–RNA interactions for Protein: P43406

Itgav, Integrin alpha-V, mousemouse

Predictions only

Length 1,044 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ItgavP43406 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
ItgavP43406 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
ItgavP43406 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
ItgavP43406 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
ItgavP43406 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
ItgavP43406 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
ItgavP43406 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
ItgavP43406 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
ItgavP43406 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
ItgavP43406 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC26.72■■□□□ 1.87
ItgavP43406 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
ItgavP43406 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
ItgavP43406 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
ItgavP43406 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
ItgavP43406 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
ItgavP43406 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
ItgavP43406 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
ItgavP43406 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
ItgavP43406 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
ItgavP43406 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
ItgavP43406 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
ItgavP43406 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
ItgavP43406 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
ItgavP43406 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
ItgavP43406 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
ItgavP43406 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
ItgavP43406 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
ItgavP43406 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
ItgavP43406 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
ItgavP43406 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
ItgavP43406 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
ItgavP43406 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
ItgavP43406 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
ItgavP43406 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
ItgavP43406 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
ItgavP43406 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
ItgavP43406 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
ItgavP43406 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
ItgavP43406 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC26.44■■□□□ 1.82
ItgavP43406 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
ItgavP43406 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
ItgavP43406 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
ItgavP43406 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
ItgavP43406 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC26.39■■□□□ 1.82
ItgavP43406 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
ItgavP43406 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
ItgavP43406 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
ItgavP43406 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
ItgavP43406 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
ItgavP43406 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
ItgavP43406 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
ItgavP43406 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
ItgavP43406 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
ItgavP43406 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
ItgavP43406 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
ItgavP43406 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
ItgavP43406 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
ItgavP43406 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
ItgavP43406 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
ItgavP43406 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
ItgavP43406 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
ItgavP43406 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
ItgavP43406 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
ItgavP43406 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
ItgavP43406 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
ItgavP43406 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
ItgavP43406 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
ItgavP43406 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
ItgavP43406 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
ItgavP43406 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
ItgavP43406 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
ItgavP43406 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
ItgavP43406 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
ItgavP43406 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
ItgavP43406 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
ItgavP43406 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
ItgavP43406 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
ItgavP43406 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
ItgavP43406 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
ItgavP43406 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC26.1■■□□□ 1.77
ItgavP43406 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
ItgavP43406 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
ItgavP43406 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
ItgavP43406 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
ItgavP43406 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
ItgavP43406 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
ItgavP43406 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
ItgavP43406 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
ItgavP43406 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
ItgavP43406 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
ItgavP43406 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
ItgavP43406 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
ItgavP43406 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
ItgavP43406 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
ItgavP43406 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
ItgavP43406 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
ItgavP43406 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
ItgavP43406 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
ItgavP43406 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC25.95■■□□□ 1.74
ItgavP43406 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.4 ms