Protein–RNA interactions for Protein: P43252

Ptgir, Prostacyclin receptor, mousemouse

Predictions only

Length 415 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtgirP43252 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PtgirP43252 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PtgirP43252 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PtgirP43252 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PtgirP43252 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PtgirP43252 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PtgirP43252 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PtgirP43252 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PtgirP43252 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PtgirP43252 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
PtgirP43252 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PtgirP43252 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PtgirP43252 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PtgirP43252 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PtgirP43252 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PtgirP43252 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PtgirP43252 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PtgirP43252 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PtgirP43252 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PtgirP43252 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PtgirP43252 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PtgirP43252 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PtgirP43252 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PtgirP43252 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
PtgirP43252 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PtgirP43252 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PtgirP43252 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PtgirP43252 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PtgirP43252 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PtgirP43252 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PtgirP43252 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PtgirP43252 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PtgirP43252 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PtgirP43252 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PtgirP43252 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PtgirP43252 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PtgirP43252 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
PtgirP43252 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
PtgirP43252 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PtgirP43252 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PtgirP43252 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PtgirP43252 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PtgirP43252 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PtgirP43252 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PtgirP43252 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
PtgirP43252 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
PtgirP43252 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PtgirP43252 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PtgirP43252 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PtgirP43252 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PtgirP43252 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PtgirP43252 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PtgirP43252 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PtgirP43252 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PtgirP43252 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PtgirP43252 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PtgirP43252 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PtgirP43252 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PtgirP43252 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PtgirP43252 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PtgirP43252 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PtgirP43252 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PtgirP43252 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PtgirP43252 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PtgirP43252 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PtgirP43252 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
PtgirP43252 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PtgirP43252 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PtgirP43252 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PtgirP43252 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PtgirP43252 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PtgirP43252 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PtgirP43252 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PtgirP43252 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PtgirP43252 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PtgirP43252 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PtgirP43252 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PtgirP43252 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
PtgirP43252 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
PtgirP43252 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PtgirP43252 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PtgirP43252 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PtgirP43252 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PtgirP43252 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PtgirP43252 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PtgirP43252 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PtgirP43252 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PtgirP43252 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PtgirP43252 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PtgirP43252 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PtgirP43252 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PtgirP43252 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PtgirP43252 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PtgirP43252 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PtgirP43252 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PtgirP43252 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PtgirP43252 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PtgirP43252 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PtgirP43252 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PtgirP43252 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 82.9 ms