Protein–RNA interactions for Protein: P43025

Clec3b, Tetranectin, mousemouse

Predictions only

Length 202 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clec3bP43025 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Clec3bP43025 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Clec3bP43025 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Clec3bP43025 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Clec3bP43025 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Clec3bP43025 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Clec3bP43025 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Clec3bP43025 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Clec3bP43025 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Clec3bP43025 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Clec3bP43025 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Clec3bP43025 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Clec3bP43025 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Clec3bP43025 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Clec3bP43025 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Clec3bP43025 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Clec3bP43025 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Clec3bP43025 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Clec3bP43025 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Clec3bP43025 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Clec3bP43025 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Clec3bP43025 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Clec3bP43025 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Clec3bP43025 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Clec3bP43025 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Clec3bP43025 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Clec3bP43025 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Clec3bP43025 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Clec3bP43025 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Clec3bP43025 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Clec3bP43025 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Clec3bP43025 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Clec3bP43025 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Clec3bP43025 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Clec3bP43025 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Clec3bP43025 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Clec3bP43025 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Clec3bP43025 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Clec3bP43025 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Clec3bP43025 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Clec3bP43025 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Clec3bP43025 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Clec3bP43025 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Clec3bP43025 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Clec3bP43025 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Clec3bP43025 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Clec3bP43025 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Clec3bP43025 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Clec3bP43025 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Clec3bP43025 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Clec3bP43025 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Clec3bP43025 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Clec3bP43025 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Clec3bP43025 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Clec3bP43025 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Clec3bP43025 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Clec3bP43025 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Clec3bP43025 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Clec3bP43025 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Clec3bP43025 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Clec3bP43025 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Clec3bP43025 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Clec3bP43025 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Clec3bP43025 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Clec3bP43025 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Clec3bP43025 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Clec3bP43025 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Clec3bP43025 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Clec3bP43025 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Clec3bP43025 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Clec3bP43025 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Clec3bP43025 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Clec3bP43025 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Clec3bP43025 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Clec3bP43025 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Clec3bP43025 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Clec3bP43025 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Clec3bP43025 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Clec3bP43025 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Clec3bP43025 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Clec3bP43025 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Clec3bP43025 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Clec3bP43025 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Clec3bP43025 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Clec3bP43025 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Clec3bP43025 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Clec3bP43025 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Clec3bP43025 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Clec3bP43025 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Clec3bP43025 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Clec3bP43025 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Clec3bP43025 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Clec3bP43025 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Clec3bP43025 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Clec3bP43025 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Clec3bP43025 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Clec3bP43025 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Clec3bP43025 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Clec3bP43025 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Clec3bP43025 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.3 ms