Protein–RNA interactions for Protein: P43025

Clec3b, Tetranectin, mousemouse

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clec3bP43025 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Clec3bP43025 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Clec3bP43025 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Clec3bP43025 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Clec3bP43025 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Clec3bP43025 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Clec3bP43025 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Clec3bP43025 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Clec3bP43025 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Clec3bP43025 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Clec3bP43025 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Clec3bP43025 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Clec3bP43025 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Clec3bP43025 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Clec3bP43025 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Clec3bP43025 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Clec3bP43025 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Clec3bP43025 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Clec3bP43025 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Clec3bP43025 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Clec3bP43025 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Clec3bP43025 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Clec3bP43025 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Clec3bP43025 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Clec3bP43025 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Clec3bP43025 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Clec3bP43025 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Clec3bP43025 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Clec3bP43025 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Clec3bP43025 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Clec3bP43025 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Clec3bP43025 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Clec3bP43025 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Clec3bP43025 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Clec3bP43025 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Clec3bP43025 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Clec3bP43025 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Clec3bP43025 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Clec3bP43025 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Clec3bP43025 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Clec3bP43025 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Clec3bP43025 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Clec3bP43025 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Clec3bP43025 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Clec3bP43025 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Clec3bP43025 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Clec3bP43025 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Clec3bP43025 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Clec3bP43025 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Clec3bP43025 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Clec3bP43025 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Clec3bP43025 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Clec3bP43025 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Clec3bP43025 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Clec3bP43025 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Clec3bP43025 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Clec3bP43025 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Clec3bP43025 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Clec3bP43025 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Clec3bP43025 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Clec3bP43025 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Clec3bP43025 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Clec3bP43025 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Clec3bP43025 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Clec3bP43025 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Clec3bP43025 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Clec3bP43025 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Clec3bP43025 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Clec3bP43025 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Clec3bP43025 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Clec3bP43025 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Clec3bP43025 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Clec3bP43025 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Clec3bP43025 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Clec3bP43025 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Clec3bP43025 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Clec3bP43025 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Clec3bP43025 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Clec3bP43025 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Clec3bP43025 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Clec3bP43025 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Clec3bP43025 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Clec3bP43025 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Clec3bP43025 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Clec3bP43025 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Clec3bP43025 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Clec3bP43025 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Clec3bP43025 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Clec3bP43025 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Clec3bP43025 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Clec3bP43025 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Clec3bP43025 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Clec3bP43025 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Clec3bP43025 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Clec3bP43025 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Clec3bP43025 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Clec3bP43025 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Clec3bP43025 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Clec3bP43025 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Clec3bP43025 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.4 ms