Protein–RNA interactions for Protein: P40630

Tfam, Transcription factor A, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TfamP40630 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TfamP40630 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TfamP40630 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TfamP40630 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TfamP40630 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TfamP40630 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
TfamP40630 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
TfamP40630 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TfamP40630 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TfamP40630 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TfamP40630 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TfamP40630 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TfamP40630 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TfamP40630 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TfamP40630 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
TfamP40630 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TfamP40630 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TfamP40630 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TfamP40630 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TfamP40630 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TfamP40630 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
TfamP40630 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
TfamP40630 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TfamP40630 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TfamP40630 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TfamP40630 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
TfamP40630 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TfamP40630 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TfamP40630 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TfamP40630 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TfamP40630 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TfamP40630 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TfamP40630 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
TfamP40630 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TfamP40630 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TfamP40630 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TfamP40630 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TfamP40630 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TfamP40630 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TfamP40630 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TfamP40630 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TfamP40630 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
TfamP40630 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TfamP40630 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TfamP40630 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TfamP40630 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TfamP40630 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TfamP40630 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TfamP40630 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TfamP40630 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TfamP40630 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TfamP40630 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TfamP40630 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TfamP40630 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TfamP40630 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TfamP40630 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TfamP40630 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TfamP40630 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TfamP40630 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TfamP40630 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TfamP40630 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TfamP40630 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TfamP40630 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TfamP40630 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TfamP40630 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TfamP40630 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TfamP40630 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TfamP40630 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
TfamP40630 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TfamP40630 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TfamP40630 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TfamP40630 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TfamP40630 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TfamP40630 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TfamP40630 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TfamP40630 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
TfamP40630 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TfamP40630 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TfamP40630 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TfamP40630 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TfamP40630 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TfamP40630 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TfamP40630 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TfamP40630 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TfamP40630 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TfamP40630 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TfamP40630 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TfamP40630 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
TfamP40630 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TfamP40630 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TfamP40630 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TfamP40630 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
TfamP40630 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TfamP40630 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TfamP40630 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TfamP40630 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TfamP40630 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
TfamP40630 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
TfamP40630 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TfamP40630 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.7 ms