Protein–RNA interactions for Protein: P38575

Upk2, Uroplakin-2, mousemouse

Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Upk2P38575 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,1■■□□□ 1,29
Upk2P38575 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC23,1■■□□□ 1,29
Upk2P38575 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23,1■■□□□ 1,29
Upk2P38575 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC23,09■■□□□ 1,29
Upk2P38575 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,08■■□□□ 1,29
Upk2P38575 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23,08■■□□□ 1,28
Upk2P38575 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC23,05■■□□□ 1,28
Upk2P38575 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,03■■□□□ 1,28
Upk2P38575 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC23,02■■□□□ 1,28
Upk2P38575 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23,02■■□□□ 1,28
Upk2P38575 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC23,01■■□□□ 1,27
Upk2P38575 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,99■■□□□ 1,27
Upk2P38575 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,98■■□□□ 1,27
Upk2P38575 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC22,98■■□□□ 1,27
Upk2P38575 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22,97■■□□□ 1,27
Upk2P38575 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,97■■□□□ 1,27
Upk2P38575 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,95■■□□□ 1,26
Upk2P38575 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,94■■□□□ 1,26
Upk2P38575 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,93■■□□□ 1,26
Upk2P38575 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22,92■■□□□ 1,26
Upk2P38575 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22,91■■□□□ 1,26
Upk2P38575 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22,89■■□□□ 1,26
Upk2P38575 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22,86■■□□□ 1,25
Upk2P38575 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22,85■■□□□ 1,25
Upk2P38575 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,84■■□□□ 1,25
Upk2P38575 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22,84■■□□□ 1,25
Upk2P38575 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC22,82■■□□□ 1,24
Upk2P38575 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22,82■■□□□ 1,24
Upk2P38575 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,82■■□□□ 1,24
Upk2P38575 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,82■■□□□ 1,24
Upk2P38575 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,82■■□□□ 1,24
Upk2P38575 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,81■■□□□ 1,24
Upk2P38575 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,79■■□□□ 1,24
Upk2P38575 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC22,78■■□□□ 1,24
Upk2P38575 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,78■■□□□ 1,24
Upk2P38575 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,77■■□□□ 1,24
Upk2P38575 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC22,77■■□□□ 1,24
Upk2P38575 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22,75■■□□□ 1,23
Upk2P38575 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,73■■□□□ 1,23
Upk2P38575 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22,73■■□□□ 1,23
Upk2P38575 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,73■■□□□ 1,23
Upk2P38575 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC22,73■■□□□ 1,23
Upk2P38575 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC22,72■■□□□ 1,23
Upk2P38575 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22,71■■□□□ 1,23
Upk2P38575 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC22,71■■□□□ 1,23
Upk2P38575 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,7■■□□□ 1,23
Upk2P38575 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22,7■■□□□ 1,23
Upk2P38575 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC22,7■■□□□ 1,22
Upk2P38575 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22,69■■□□□ 1,22
Upk2P38575 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC22,69■■□□□ 1,22
Upk2P38575 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC22,67■■□□□ 1,22
Upk2P38575 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,67■■□□□ 1,22
Upk2P38575 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,67■■□□□ 1,22
Upk2P38575 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22,66■■□□□ 1,22
Upk2P38575 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,65■■□□□ 1,22
Upk2P38575 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,64■■□□□ 1,22
Upk2P38575 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,64■■□□□ 1,21
Upk2P38575 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,62■■□□□ 1,21
Upk2P38575 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC22,61■■□□□ 1,21
Upk2P38575 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22,61■■□□□ 1,21
Upk2P38575 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,6■■□□□ 1,21
Upk2P38575 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22,6■■□□□ 1,21
Upk2P38575 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC22,59■■□□□ 1,21
Upk2P38575 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22,59■■□□□ 1,21
Upk2P38575 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22,58■■□□□ 1,21
Upk2P38575 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC22,58■■□□□ 1,21
Upk2P38575 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,58■■□□□ 1,2
Upk2P38575 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,58■■□□□ 1,2
Upk2P38575 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,57■■□□□ 1,2
Upk2P38575 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,56■■□□□ 1,2
Upk2P38575 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC22,56■■□□□ 1,2
Upk2P38575 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,55■■□□□ 1,2
Upk2P38575 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC22,55■■□□□ 1,2
Upk2P38575 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC22,54■■□□□ 1,2
Upk2P38575 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22,54■■□□□ 1,2
Upk2P38575 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC22,54■■□□□ 1,2
Upk2P38575 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22,54■■□□□ 1,2
Upk2P38575 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22,52■■□□□ 1,2
Upk2P38575 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22,51■■□□□ 1,19
Upk2P38575 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22,51■■□□□ 1,19
Upk2P38575 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,5■■□□□ 1,19
Upk2P38575 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC22,5■■□□□ 1,19
Upk2P38575 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22,49■■□□□ 1,19
Upk2P38575 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22,49■■□□□ 1,19
Upk2P38575 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC22,49■■□□□ 1,19
Upk2P38575 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22,47■■□□□ 1,19
Upk2P38575 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22,46■■□□□ 1,19
Upk2P38575 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC22,46■■□□□ 1,19
Upk2P38575 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22,46■■□□□ 1,19
Upk2P38575 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC22,45■■□□□ 1,19
Upk2P38575 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22,45■■□□□ 1,18
Upk2P38575 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC22,45■■□□□ 1,18
Upk2P38575 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,44■■□□□ 1,18
Upk2P38575 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22,43■■□□□ 1,18
Upk2P38575 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC22,43■■□□□ 1,18
Upk2P38575 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,41■■□□□ 1,18
Upk2P38575 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,41■■□□□ 1,18
Upk2P38575 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,41■■□□□ 1,18
Upk2P38575 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC22,4■■□□□ 1,18
Upk2P38575 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22,4■■□□□ 1,18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12,4 ms