Protein–RNA interactions for Protein: P35951

Ldlr, Low-density lipoprotein receptor, mousemouse

Predictions only

Length 862 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LdlrP35951 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
LdlrP35951 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
LdlrP35951 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
LdlrP35951 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
LdlrP35951 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
LdlrP35951 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
LdlrP35951 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
LdlrP35951 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
LdlrP35951 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
LdlrP35951 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
LdlrP35951 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
LdlrP35951 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
LdlrP35951 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
LdlrP35951 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
LdlrP35951 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
LdlrP35951 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
LdlrP35951 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
LdlrP35951 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
LdlrP35951 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
LdlrP35951 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
LdlrP35951 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
LdlrP35951 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
LdlrP35951 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
LdlrP35951 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
LdlrP35951 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
LdlrP35951 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
LdlrP35951 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
LdlrP35951 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
LdlrP35951 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
LdlrP35951 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
LdlrP35951 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
LdlrP35951 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
LdlrP35951 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
LdlrP35951 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
LdlrP35951 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
LdlrP35951 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
LdlrP35951 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
LdlrP35951 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
LdlrP35951 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
LdlrP35951 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
LdlrP35951 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
LdlrP35951 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
LdlrP35951 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
LdlrP35951 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
LdlrP35951 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
LdlrP35951 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
LdlrP35951 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.68
LdlrP35951 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
LdlrP35951 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
LdlrP35951 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
LdlrP35951 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
LdlrP35951 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
LdlrP35951 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
LdlrP35951 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
LdlrP35951 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
LdlrP35951 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
LdlrP35951 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
LdlrP35951 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
LdlrP35951 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
LdlrP35951 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
LdlrP35951 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
LdlrP35951 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
LdlrP35951 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
LdlrP35951 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
LdlrP35951 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
LdlrP35951 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
LdlrP35951 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
LdlrP35951 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
LdlrP35951 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
LdlrP35951 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
LdlrP35951 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
LdlrP35951 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
LdlrP35951 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
LdlrP35951 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
LdlrP35951 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
LdlrP35951 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
LdlrP35951 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
LdlrP35951 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
LdlrP35951 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
LdlrP35951 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
LdlrP35951 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
LdlrP35951 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
LdlrP35951 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
LdlrP35951 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
LdlrP35951 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
LdlrP35951 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
LdlrP35951 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
LdlrP35951 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
LdlrP35951 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
LdlrP35951 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
LdlrP35951 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
LdlrP35951 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
LdlrP35951 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
LdlrP35951 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
LdlrP35951 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
LdlrP35951 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
LdlrP35951 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
LdlrP35951 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
LdlrP35951 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
LdlrP35951 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms