Protein–RNA interactions for Protein: P35329

Cd22, B-cell receptor CD22, mousemouse

Predictions only

Length 862 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd22P35329 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30,23■■■□□ 2,43
Cd22P35329 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,2■■■□□ 2,43
Cd22P35329 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC30,19■■■□□ 2,42
Cd22P35329 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30,15■■■□□ 2,42
Cd22P35329 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC30,15■■■□□ 2,42
Cd22P35329 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC30,14■■■□□ 2,42
Cd22P35329 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,14■■■□□ 2,41
Cd22P35329 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC30,12■■■□□ 2,41
Cd22P35329 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC30,11■■■□□ 2,41
Cd22P35329 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,1■■■□□ 2,41
Cd22P35329 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,1■■■□□ 2,41
Cd22P35329 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC30,07■■■□□ 2,4
Cd22P35329 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30,06■■■□□ 2,4
Cd22P35329 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,05■■■□□ 2,4
Cd22P35329 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30,05■■■□□ 2,4
Cd22P35329 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,02■■■□□ 2,4
Cd22P35329 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,01■■■□□ 2,39
Cd22P35329 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC30,01■■■□□ 2,39
Cd22P35329 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29,99■■■□□ 2,39
Cd22P35329 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC29,98■■■□□ 2,39
Cd22P35329 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,98■■■□□ 2,39
Cd22P35329 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,97■■■□□ 2,39
Cd22P35329 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC29,96■■■□□ 2,39
Cd22P35329 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29,93■■■□□ 2,38
Cd22P35329 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,93■■■□□ 2,38
Cd22P35329 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC29,92■■■□□ 2,38
Cd22P35329 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29,91■■■□□ 2,38
Cd22P35329 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29,89■■■□□ 2,38
Cd22P35329 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,89■■■□□ 2,38
Cd22P35329 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29,88■■■□□ 2,37
Cd22P35329 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,87■■■□□ 2,37
Cd22P35329 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,87■■■□□ 2,37
Cd22P35329 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC29,86■■■□□ 2,37
Cd22P35329 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,86■■■□□ 2,37
Cd22P35329 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC29,85■■■□□ 2,37
Cd22P35329 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,85■■■□□ 2,37
Cd22P35329 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,85■■■□□ 2,37
Cd22P35329 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29,85■■■□□ 2,37
Cd22P35329 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,83■■■□□ 2,37
Cd22P35329 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC29,81■■■□□ 2,36
Cd22P35329 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC29,78■■■□□ 2,36
Cd22P35329 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,77■■■□□ 2,36
Cd22P35329 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC29,77■■■□□ 2,36
Cd22P35329 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,75■■■□□ 2,35
Cd22P35329 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,71■■■□□ 2,35
Cd22P35329 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC29,71■■■□□ 2,35
Cd22P35329 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,69■■■□□ 2,34
Cd22P35329 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC29,69■■■□□ 2,34
Cd22P35329 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,68■■■□□ 2,34
Cd22P35329 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29,68■■■□□ 2,34
Cd22P35329 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC29,67■■■□□ 2,34
Cd22P35329 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,67■■■□□ 2,34
Cd22P35329 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC29,66■■■□□ 2,34
Cd22P35329 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29,66■■■□□ 2,34
Cd22P35329 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29,65■■■□□ 2,34
Cd22P35329 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC29,63■■■□□ 2,33
Cd22P35329 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,62■■■□□ 2,33
Cd22P35329 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC29,61■■■□□ 2,33
Cd22P35329 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,61■■■□□ 2,33
Cd22P35329 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,61■■■□□ 2,33
Cd22P35329 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC29,61■■■□□ 2,33
Cd22P35329 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC29,6■■■□□ 2,33
Cd22P35329 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC29,6■■■□□ 2,33
Cd22P35329 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29,58■■■□□ 2,33
Cd22P35329 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29,58■■■□□ 2,33
Cd22P35329 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC29,57■■■□□ 2,32
Cd22P35329 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29,56■■■□□ 2,32
Cd22P35329 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC29,56■■■□□ 2,32
Cd22P35329 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,53■■■□□ 2,32
Cd22P35329 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,52■■■□□ 2,32
Cd22P35329 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29,52■■■□□ 2,32
Cd22P35329 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29,5■■■□□ 2,31
Cd22P35329 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29,48■■■□□ 2,31
Cd22P35329 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,47■■■□□ 2,31
Cd22P35329 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,47■■■□□ 2,31
Cd22P35329 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29,47■■■□□ 2,31
Cd22P35329 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC29,45■■■□□ 2,31
Cd22P35329 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC29,44■■■□□ 2,3
Cd22P35329 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC29,41■■■□□ 2,3
Cd22P35329 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,4■■■□□ 2,3
Cd22P35329 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC29,39■■■□□ 2,3
Cd22P35329 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,38■■■□□ 2,29
Cd22P35329 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,38■■■□□ 2,29
Cd22P35329 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC29,37■■■□□ 2,29
Cd22P35329 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29,34■■■□□ 2,29
Cd22P35329 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,34■■■□□ 2,29
Cd22P35329 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC29,34■■■□□ 2,29
Cd22P35329 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,34■■■□□ 2,29
Cd22P35329 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,33■■■□□ 2,29
Cd22P35329 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,33■■■□□ 2,29
Cd22P35329 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,33■■■□□ 2,29
Cd22P35329 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29,32■■■□□ 2,28
Cd22P35329 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,31■■■□□ 2,28
Cd22P35329 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,3■■■□□ 2,28
Cd22P35329 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC29,27■■■□□ 2,28
Cd22P35329 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,27■■■□□ 2,28
Cd22P35329 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC29,26■■■□□ 2,27
Cd22P35329 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,25■■■□□ 2,27
Cd22P35329 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,25■■■□□ 2,27
Cd22P35329 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,24■■■□□ 2,27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18,2 ms