Protein–RNA interactions for Protein: P30999

Ctnnd1, Catenin delta-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 938 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnnd1P30999 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Ctnnd1P30999 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Ctnnd1P30999 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Ctnnd1P30999 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Ctnnd1P30999 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
Ctnnd1P30999 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Ctnnd1P30999 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Ctnnd1P30999 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Ctnnd1P30999 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Ctnnd1P30999 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Ctnnd1P30999 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Ctnnd1P30999 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Ctnnd1P30999 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Ctnnd1P30999 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Ctnnd1P30999 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Ctnnd1P30999 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Ctnnd1P30999 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Ctnnd1P30999 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Ctnnd1P30999 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Ctnnd1P30999 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Ctnnd1P30999 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Ctnnd1P30999 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Ctnnd1P30999 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Ctnnd1P30999 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Ctnnd1P30999 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Ctnnd1P30999 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Ctnnd1P30999 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Ctnnd1P30999 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Ctnnd1P30999 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
Ctnnd1P30999 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Ctnnd1P30999 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Ctnnd1P30999 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Ctnnd1P30999 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
Ctnnd1P30999 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Ctnnd1P30999 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Ctnnd1P30999 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Ctnnd1P30999 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
Ctnnd1P30999 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Ctnnd1P30999 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Ctnnd1P30999 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Ctnnd1P30999 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Ctnnd1P30999 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Ctnnd1P30999 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Ctnnd1P30999 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Ctnnd1P30999 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Ctnnd1P30999 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
Ctnnd1P30999 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Ctnnd1P30999 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Ctnnd1P30999 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
Ctnnd1P30999 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Ctnnd1P30999 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Ctnnd1P30999 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Ctnnd1P30999 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Ctnnd1P30999 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Ctnnd1P30999 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Ctnnd1P30999 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Ctnnd1P30999 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Ctnnd1P30999 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Ctnnd1P30999 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Ctnnd1P30999 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Ctnnd1P30999 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Ctnnd1P30999 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Ctnnd1P30999 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Ctnnd1P30999 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Ctnnd1P30999 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Ctnnd1P30999 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Ctnnd1P30999 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Ctnnd1P30999 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC27.39■■□□□ 1.97
Ctnnd1P30999 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Ctnnd1P30999 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
Ctnnd1P30999 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Ctnnd1P30999 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Ctnnd1P30999 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Ctnnd1P30999 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
Ctnnd1P30999 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Ctnnd1P30999 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
Ctnnd1P30999 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Ctnnd1P30999 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Ctnnd1P30999 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Ctnnd1P30999 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Ctnnd1P30999 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Ctnnd1P30999 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Ctnnd1P30999 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Ctnnd1P30999 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Ctnnd1P30999 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Ctnnd1P30999 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Ctnnd1P30999 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Ctnnd1P30999 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Ctnnd1P30999 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Ctnnd1P30999 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Ctnnd1P30999 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.95
Ctnnd1P30999 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Ctnnd1P30999 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
Ctnnd1P30999 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
Ctnnd1P30999 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Ctnnd1P30999 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Ctnnd1P30999 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Ctnnd1P30999 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Ctnnd1P30999 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Ctnnd1P30999 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16 ms