Protein–RNA interactions for Protein: P28667

Marcksl1, MARCKS-related protein, mousemouse

Predictions only

Length 200 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Marcksl1P28667 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC27,37■■□□□ 1,97
Marcksl1P28667 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC27,34■■□□□ 1,97
Marcksl1P28667 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC27,3■■□□□ 1,96
Marcksl1P28667 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC27,29■■□□□ 1,96
Marcksl1P28667 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27,28■■□□□ 1,96
Marcksl1P28667 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,27■■□□□ 1,96
Marcksl1P28667 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC27,26■■□□□ 1,95
Marcksl1P28667 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,25■■□□□ 1,95
Marcksl1P28667 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,25■■□□□ 1,95
Marcksl1P28667 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC27,24■■□□□ 1,95
Marcksl1P28667 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,23■■□□□ 1,95
Marcksl1P28667 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27,23■■□□□ 1,95
Marcksl1P28667 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,21■■□□□ 1,95
Marcksl1P28667 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC27,19■■□□□ 1,94
Marcksl1P28667 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC27,19■■□□□ 1,94
Marcksl1P28667 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,19■■□□□ 1,94
Marcksl1P28667 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC27,18■■□□□ 1,94
Marcksl1P28667 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27,18■■□□□ 1,94
Marcksl1P28667 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,14■■□□□ 1,94
Marcksl1P28667 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27,13■■□□□ 1,93
Marcksl1P28667 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,13■■□□□ 1,93
Marcksl1P28667 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,12■■□□□ 1,93
Marcksl1P28667 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27,12■■□□□ 1,93
Marcksl1P28667 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,11■■□□□ 1,93
Marcksl1P28667 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,09■■□□□ 1,93
Marcksl1P28667 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC27,06■■□□□ 1,92
Marcksl1P28667 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC27,05■■□□□ 1,92
Marcksl1P28667 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,04■■□□□ 1,92
Marcksl1P28667 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,04■■□□□ 1,92
Marcksl1P28667 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC27,03■■□□□ 1,92
Marcksl1P28667 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,02■■□□□ 1,92
Marcksl1P28667 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,02■■□□□ 1,92
Marcksl1P28667 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1,91
Marcksl1P28667 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1,91
Marcksl1P28667 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1,91
Marcksl1P28667 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1,91
Marcksl1P28667 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC26,97■■□□□ 1,91
Marcksl1P28667 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC26,97■■□□□ 1,91
Marcksl1P28667 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,97■■□□□ 1,91
Marcksl1P28667 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26,93■■□□□ 1,9
Marcksl1P28667 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26,92■■□□□ 1,9
Marcksl1P28667 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,92■■□□□ 1,9
Marcksl1P28667 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC26,91■■□□□ 1,9
Marcksl1P28667 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,9■■□□□ 1,9
Marcksl1P28667 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,9■■□□□ 1,9
Marcksl1P28667 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26,9■■□□□ 1,9
Marcksl1P28667 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26,89■■□□□ 1,9
Marcksl1P28667 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,89■■□□□ 1,9
Marcksl1P28667 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,89■■□□□ 1,9
Marcksl1P28667 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,88■■□□□ 1,89
Marcksl1P28667 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC26,86■■□□□ 1,89
Marcksl1P28667 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC26,85■■□□□ 1,89
Marcksl1P28667 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC26,84■■□□□ 1,89
Marcksl1P28667 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,81■■□□□ 1,88
Marcksl1P28667 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC26,79■■□□□ 1,88
Marcksl1P28667 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,79■■□□□ 1,88
Marcksl1P28667 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,77■■□□□ 1,88
Marcksl1P28667 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26,75■■□□□ 1,87
Marcksl1P28667 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26,74■■□□□ 1,87
Marcksl1P28667 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26,74■■□□□ 1,87
Marcksl1P28667 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,73■■□□□ 1,87
Marcksl1P28667 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26,73■■□□□ 1,87
Marcksl1P28667 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC26,73■■□□□ 1,87
Marcksl1P28667 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC26,72■■□□□ 1,87
Marcksl1P28667 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,72■■□□□ 1,87
Marcksl1P28667 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,72■■□□□ 1,87
Marcksl1P28667 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC26,7■■□□□ 1,87
Marcksl1P28667 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,7■■□□□ 1,86
Marcksl1P28667 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,69■■□□□ 1,86
Marcksl1P28667 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26,68■■□□□ 1,86
Marcksl1P28667 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,68■■□□□ 1,86
Marcksl1P28667 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26,67■■□□□ 1,86
Marcksl1P28667 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,67■■□□□ 1,86
Marcksl1P28667 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,66■■□□□ 1,86
Marcksl1P28667 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,66■■□□□ 1,86
Marcksl1P28667 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,66■■□□□ 1,86
Marcksl1P28667 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC26,65■■□□□ 1,86
Marcksl1P28667 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,65■■□□□ 1,86
Marcksl1P28667 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC26,64■■□□□ 1,86
Marcksl1P28667 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC26,64■■□□□ 1,86
Marcksl1P28667 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,64■■□□□ 1,86
Marcksl1P28667 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC26,64■■□□□ 1,86
Marcksl1P28667 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,64■■□□□ 1,85
Marcksl1P28667 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,64■■□□□ 1,85
Marcksl1P28667 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC26,63■■□□□ 1,85
Marcksl1P28667 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26,62■■□□□ 1,85
Marcksl1P28667 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC26,62■■□□□ 1,85
Marcksl1P28667 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26,59■■□□□ 1,85
Marcksl1P28667 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,59■■□□□ 1,85
Marcksl1P28667 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC26,58■■□□□ 1,85
Marcksl1P28667 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC26,57■■□□□ 1,84
Marcksl1P28667 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,56■■□□□ 1,84
Marcksl1P28667 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC26,56■■□□□ 1,84
Marcksl1P28667 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC26,55■■□□□ 1,84
Marcksl1P28667 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC26,55■■□□□ 1,84
Marcksl1P28667 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC26,54■■□□□ 1,84
Marcksl1P28667 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC26,53■■□□□ 1,84
Marcksl1P28667 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC26,53■■□□□ 1,84
Marcksl1P28667 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,53■■□□□ 1,84
Marcksl1P28667 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC26,49■■□□□ 1,83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms