Protein–RNA interactions for Protein: P28667

Marcksl1, MARCKS-related protein, mousemouse

Predictions only

Length 200 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Marcksl1P28667 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Marcksl1P28667 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Marcksl1P28667 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Marcksl1P28667 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Marcksl1P28667 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Marcksl1P28667 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Marcksl1P28667 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
Marcksl1P28667 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Marcksl1P28667 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Marcksl1P28667 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
Marcksl1P28667 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Marcksl1P28667 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Marcksl1P28667 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Marcksl1P28667 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Marcksl1P28667 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
Marcksl1P28667 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Marcksl1P28667 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Marcksl1P28667 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Marcksl1P28667 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Marcksl1P28667 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Marcksl1P28667 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Marcksl1P28667 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Marcksl1P28667 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Marcksl1P28667 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Marcksl1P28667 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Marcksl1P28667 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Marcksl1P28667 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Marcksl1P28667 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Marcksl1P28667 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Marcksl1P28667 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Marcksl1P28667 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Marcksl1P28667 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Marcksl1P28667 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Marcksl1P28667 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Marcksl1P28667 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Marcksl1P28667 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
Marcksl1P28667 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Marcksl1P28667 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
Marcksl1P28667 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Marcksl1P28667 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Marcksl1P28667 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Marcksl1P28667 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Marcksl1P28667 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Marcksl1P28667 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Marcksl1P28667 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Marcksl1P28667 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Marcksl1P28667 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Marcksl1P28667 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Marcksl1P28667 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Marcksl1P28667 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Marcksl1P28667 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Marcksl1P28667 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Marcksl1P28667 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
Marcksl1P28667 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Marcksl1P28667 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Marcksl1P28667 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Marcksl1P28667 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Marcksl1P28667 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Marcksl1P28667 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Marcksl1P28667 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Marcksl1P28667 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Marcksl1P28667 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Marcksl1P28667 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Marcksl1P28667 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Marcksl1P28667 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Marcksl1P28667 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Marcksl1P28667 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
Marcksl1P28667 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Marcksl1P28667 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Marcksl1P28667 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Marcksl1P28667 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Marcksl1P28667 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Marcksl1P28667 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Marcksl1P28667 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Marcksl1P28667 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Marcksl1P28667 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Marcksl1P28667 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Marcksl1P28667 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Marcksl1P28667 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC26.64■■□□□ 1.86
Marcksl1P28667 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
Marcksl1P28667 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Marcksl1P28667 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC26.64■■□□□ 1.86
Marcksl1P28667 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Marcksl1P28667 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Marcksl1P28667 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Marcksl1P28667 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Marcksl1P28667 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
Marcksl1P28667 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Marcksl1P28667 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Marcksl1P28667 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Marcksl1P28667 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
Marcksl1P28667 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Marcksl1P28667 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Marcksl1P28667 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Marcksl1P28667 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Marcksl1P28667 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Marcksl1P28667 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Marcksl1P28667 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Marcksl1P28667 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Marcksl1P28667 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.9 ms