Protein–RNA interactions for Protein: P28658

Atxn10, Ataxin-10, mousemouse

Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atxn10P28658 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC26,61■■□□□ 1,85
Atxn10P28658 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,61■■□□□ 1,85
Atxn10P28658 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC26,61■■□□□ 1,85
Atxn10P28658 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26,6■■□□□ 1,85
Atxn10P28658 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC26,59■■□□□ 1,85
Atxn10P28658 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,57■■□□□ 1,84
Atxn10P28658 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,55■■□□□ 1,84
Atxn10P28658 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC26,54■■□□□ 1,84
Atxn10P28658 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,53■■□□□ 1,84
Atxn10P28658 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,48■■□□□ 1,83
Atxn10P28658 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC26,48■■□□□ 1,83
Atxn10P28658 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC26,47■■□□□ 1,83
Atxn10P28658 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC26,46■■□□□ 1,83
Atxn10P28658 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,46■■□□□ 1,83
Atxn10P28658 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,46■■□□□ 1,83
Atxn10P28658 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,43■■□□□ 1,82
Atxn10P28658 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,42■■□□□ 1,82
Atxn10P28658 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,42■■□□□ 1,82
Atxn10P28658 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,42■■□□□ 1,82
Atxn10P28658 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,38■■□□□ 1,81
Atxn10P28658 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC26,37■■□□□ 1,81
Atxn10P28658 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26,37■■□□□ 1,81
Atxn10P28658 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,37■■□□□ 1,81
Atxn10P28658 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC26,35■■□□□ 1,81
Atxn10P28658 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26,33■■□□□ 1,81
Atxn10P28658 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26,3■■□□□ 1,8
Atxn10P28658 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26,3■■□□□ 1,8
Atxn10P28658 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,29■■□□□ 1,8
Atxn10P28658 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC26,28■■□□□ 1,8
Atxn10P28658 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26,28■■□□□ 1,8
Atxn10P28658 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,27■■□□□ 1,8
Atxn10P28658 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC26,27■■□□□ 1,8
Atxn10P28658 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,26■■□□□ 1,79
Atxn10P28658 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC26,26■■□□□ 1,79
Atxn10P28658 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC26,26■■□□□ 1,79
Atxn10P28658 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC26,23■■□□□ 1,79
Atxn10P28658 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,23■■□□□ 1,79
Atxn10P28658 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,22■■□□□ 1,79
Atxn10P28658 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,22■■□□□ 1,79
Atxn10P28658 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,22■■□□□ 1,79
Atxn10P28658 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,2■■□□□ 1,78
Atxn10P28658 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,19■■□□□ 1,78
Atxn10P28658 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC26,18■■□□□ 1,78
Atxn10P28658 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC26,17■■□□□ 1,78
Atxn10P28658 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,17■■□□□ 1,78
Atxn10P28658 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26,17■■□□□ 1,78
Atxn10P28658 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC26,15■■□□□ 1,78
Atxn10P28658 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,15■■□□□ 1,78
Atxn10P28658 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,14■■□□□ 1,78
Atxn10P28658 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,14■■□□□ 1,77
Atxn10P28658 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26,13■■□□□ 1,77
Atxn10P28658 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26,12■■□□□ 1,77
Atxn10P28658 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,12■■□□□ 1,77
Atxn10P28658 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26,11■■□□□ 1,77
Atxn10P28658 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,1■■□□□ 1,77
Atxn10P28658 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,1■■□□□ 1,77
Atxn10P28658 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC26,1■■□□□ 1,77
Atxn10P28658 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC26,1■■□□□ 1,77
Atxn10P28658 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC26,09■■□□□ 1,77
Atxn10P28658 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,09■■□□□ 1,77
Atxn10P28658 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,06■■□□□ 1,76
Atxn10P28658 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,05■■□□□ 1,76
Atxn10P28658 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC26,05■■□□□ 1,76
Atxn10P28658 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,04■■□□□ 1,76
Atxn10P28658 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,04■■□□□ 1,76
Atxn10P28658 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,03■■□□□ 1,76
Atxn10P28658 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC26,03■■□□□ 1,76
Atxn10P28658 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,03■■□□□ 1,76
Atxn10P28658 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC26,02■■□□□ 1,76
Atxn10P28658 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1,75
Atxn10P28658 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25,99■■□□□ 1,75
Atxn10P28658 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,98■■□□□ 1,75
Atxn10P28658 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,98■■□□□ 1,75
Atxn10P28658 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC25,96■■□□□ 1,75
Atxn10P28658 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC25,96■■□□□ 1,75
Atxn10P28658 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25,96■■□□□ 1,75
Atxn10P28658 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC25,95■■□□□ 1,74
Atxn10P28658 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,94■■□□□ 1,74
Atxn10P28658 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,94■■□□□ 1,74
Atxn10P28658 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,93■■□□□ 1,74
Atxn10P28658 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25,93■■□□□ 1,74
Atxn10P28658 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25,93■■□□□ 1,74
Atxn10P28658 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,91■■□□□ 1,74
Atxn10P28658 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC25,91■■□□□ 1,74
Atxn10P28658 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25,9■■□□□ 1,74
Atxn10P28658 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25,89■■□□□ 1,74
Atxn10P28658 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC25,89■■□□□ 1,74
Atxn10P28658 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25,89■■□□□ 1,73
Atxn10P28658 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25,88■■□□□ 1,73
Atxn10P28658 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC25,87■■□□□ 1,73
Atxn10P28658 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,86■■□□□ 1,73
Atxn10P28658 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC25,86■■□□□ 1,73
Atxn10P28658 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,85■■□□□ 1,73
Atxn10P28658 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25,84■■□□□ 1,73
Atxn10P28658 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,84■■□□□ 1,73
Atxn10P28658 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25,84■■□□□ 1,73
Atxn10P28658 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC25,84■■□□□ 1,73
Atxn10P28658 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC25,83■■□□□ 1,73
Atxn10P28658 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC25,83■■□□□ 1,72
Atxn10P28658 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25,82■■□□□ 1,72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11,8 ms