Protein–RNA interactions for Protein: P28028

Braf, Serine/threonine-protein kinase B-raf, mousemouse

Predictions only

Length 804 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BrafP28028 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
BrafP28028 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
BrafP28028 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
BrafP28028 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
BrafP28028 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
BrafP28028 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
BrafP28028 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
BrafP28028 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
BrafP28028 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
BrafP28028 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
BrafP28028 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
BrafP28028 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
BrafP28028 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
BrafP28028 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
BrafP28028 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
BrafP28028 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
BrafP28028 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
BrafP28028 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
BrafP28028 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
BrafP28028 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
BrafP28028 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
BrafP28028 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
BrafP28028 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
BrafP28028 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
BrafP28028 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
BrafP28028 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
BrafP28028 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
BrafP28028 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
BrafP28028 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
BrafP28028 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
BrafP28028 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
BrafP28028 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
BrafP28028 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
BrafP28028 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
BrafP28028 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
BrafP28028 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
BrafP28028 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
BrafP28028 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
BrafP28028 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
BrafP28028 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
BrafP28028 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
BrafP28028 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
BrafP28028 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
BrafP28028 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
BrafP28028 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
BrafP28028 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
BrafP28028 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
BrafP28028 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
BrafP28028 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
BrafP28028 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
BrafP28028 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
BrafP28028 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
BrafP28028 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
BrafP28028 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
BrafP28028 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
BrafP28028 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
BrafP28028 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
BrafP28028 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
BrafP28028 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
BrafP28028 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
BrafP28028 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
BrafP28028 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
BrafP28028 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
BrafP28028 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
BrafP28028 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
BrafP28028 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
BrafP28028 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
BrafP28028 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
BrafP28028 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
BrafP28028 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
BrafP28028 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
BrafP28028 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
BrafP28028 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
BrafP28028 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
BrafP28028 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
BrafP28028 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
BrafP28028 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
BrafP28028 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
BrafP28028 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
BrafP28028 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
BrafP28028 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
BrafP28028 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
BrafP28028 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
BrafP28028 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
BrafP28028 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
BrafP28028 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
BrafP28028 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
BrafP28028 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
BrafP28028 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
BrafP28028 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
BrafP28028 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
BrafP28028 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
BrafP28028 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
BrafP28028 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
BrafP28028 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
BrafP28028 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
BrafP28028 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
BrafP28028 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
BrafP28028 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
BrafP28028 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.4 ms