Protein–RNA interactions for Protein: P23950

Zfp36l1, mRNA decay activator protein ZFP36L1, mousemouse

Predictions only

Length 338 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp36l1P23950 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Zfp36l1P23950 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Zfp36l1P23950 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Zfp36l1P23950 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Zfp36l1P23950 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Zfp36l1P23950 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Zfp36l1P23950 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Zfp36l1P23950 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Zfp36l1P23950 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Zfp36l1P23950 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
Zfp36l1P23950 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
Zfp36l1P23950 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Zfp36l1P23950 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Zfp36l1P23950 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
Zfp36l1P23950 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Zfp36l1P23950 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
Zfp36l1P23950 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Zfp36l1P23950 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Zfp36l1P23950 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Zfp36l1P23950 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Zfp36l1P23950 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Zfp36l1P23950 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
Zfp36l1P23950 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Zfp36l1P23950 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Zfp36l1P23950 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Zfp36l1P23950 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Zfp36l1P23950 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Zfp36l1P23950 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Zfp36l1P23950 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Zfp36l1P23950 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Zfp36l1P23950 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Zfp36l1P23950 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Zfp36l1P23950 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
Zfp36l1P23950 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Zfp36l1P23950 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Zfp36l1P23950 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Zfp36l1P23950 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Zfp36l1P23950 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Zfp36l1P23950 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Zfp36l1P23950 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Zfp36l1P23950 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Zfp36l1P23950 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
Zfp36l1P23950 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Zfp36l1P23950 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Zfp36l1P23950 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Zfp36l1P23950 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Zfp36l1P23950 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Zfp36l1P23950 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Zfp36l1P23950 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Zfp36l1P23950 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Zfp36l1P23950 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Zfp36l1P23950 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Zfp36l1P23950 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Zfp36l1P23950 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Zfp36l1P23950 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Zfp36l1P23950 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Zfp36l1P23950 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Zfp36l1P23950 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Zfp36l1P23950 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Zfp36l1P23950 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Zfp36l1P23950 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Zfp36l1P23950 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Zfp36l1P23950 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Zfp36l1P23950 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Zfp36l1P23950 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Zfp36l1P23950 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Zfp36l1P23950 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Zfp36l1P23950 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Zfp36l1P23950 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Zfp36l1P23950 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Zfp36l1P23950 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Zfp36l1P23950 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Zfp36l1P23950 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Zfp36l1P23950 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Zfp36l1P23950 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Zfp36l1P23950 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Zfp36l1P23950 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Zfp36l1P23950 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Zfp36l1P23950 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Zfp36l1P23950 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Zfp36l1P23950 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Zfp36l1P23950 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Zfp36l1P23950 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Zfp36l1P23950 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Zfp36l1P23950 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Zfp36l1P23950 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Zfp36l1P23950 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Zfp36l1P23950 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Zfp36l1P23950 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Zfp36l1P23950 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Zfp36l1P23950 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Zfp36l1P23950 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Zfp36l1P23950 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Zfp36l1P23950 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Zfp36l1P23950 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Zfp36l1P23950 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Zfp36l1P23950 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Zfp36l1P23950 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Zfp36l1P23950 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Zfp36l1P23950 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.8 ms