Protein–RNA interactions for Protein: P23818

Gria1, Glutamate receptor 1, mousemouse

Predictions only

Length 907 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gria1P23818 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Gria1P23818 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Gria1P23818 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Gria1P23818 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
Gria1P23818 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Gria1P23818 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Gria1P23818 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Gria1P23818 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Gria1P23818 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Gria1P23818 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Gria1P23818 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Gria1P23818 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Gria1P23818 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Gria1P23818 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
Gria1P23818 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Gria1P23818 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Gria1P23818 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Gria1P23818 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Gria1P23818 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
Gria1P23818 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Gria1P23818 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Gria1P23818 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
Gria1P23818 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Gria1P23818 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Gria1P23818 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Gria1P23818 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Gria1P23818 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Gria1P23818 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Gria1P23818 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Gria1P23818 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Gria1P23818 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Gria1P23818 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Gria1P23818 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Gria1P23818 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Gria1P23818 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Gria1P23818 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Gria1P23818 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Gria1P23818 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Gria1P23818 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Gria1P23818 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Gria1P23818 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Gria1P23818 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Gria1P23818 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Gria1P23818 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Gria1P23818 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Gria1P23818 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Gria1P23818 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Gria1P23818 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Gria1P23818 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Gria1P23818 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Gria1P23818 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Gria1P23818 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Gria1P23818 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Gria1P23818 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Gria1P23818 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Gria1P23818 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Gria1P23818 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Gria1P23818 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Gria1P23818 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Gria1P23818 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Gria1P23818 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Gria1P23818 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Gria1P23818 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Gria1P23818 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Gria1P23818 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Gria1P23818 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Gria1P23818 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Gria1P23818 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Gria1P23818 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Gria1P23818 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Gria1P23818 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Gria1P23818 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Gria1P23818 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Gria1P23818 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Gria1P23818 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Gria1P23818 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Gria1P23818 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Gria1P23818 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Gria1P23818 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Gria1P23818 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Gria1P23818 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Gria1P23818 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Gria1P23818 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Gria1P23818 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Gria1P23818 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Gria1P23818 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Gria1P23818 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Gria1P23818 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Gria1P23818 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Gria1P23818 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Gria1P23818 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Gria1P23818 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Gria1P23818 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Gria1P23818 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Gria1P23818 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Gria1P23818 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Gria1P23818 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Gria1P23818 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Gria1P23818 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Gria1P23818 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms