Protein–RNA interactions for Protein: P20782

Chrne, Acetylcholine receptor subunit epsilon, mousemouse

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChrneP20782 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ChrneP20782 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ChrneP20782 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ChrneP20782 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ChrneP20782 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ChrneP20782 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
ChrneP20782 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
ChrneP20782 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ChrneP20782 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ChrneP20782 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ChrneP20782 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ChrneP20782 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ChrneP20782 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ChrneP20782 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ChrneP20782 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ChrneP20782 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ChrneP20782 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ChrneP20782 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ChrneP20782 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ChrneP20782 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ChrneP20782 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ChrneP20782 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ChrneP20782 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ChrneP20782 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ChrneP20782 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ChrneP20782 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
ChrneP20782 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ChrneP20782 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ChrneP20782 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
ChrneP20782 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ChrneP20782 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ChrneP20782 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ChrneP20782 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ChrneP20782 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ChrneP20782 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ChrneP20782 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ChrneP20782 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ChrneP20782 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ChrneP20782 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
ChrneP20782 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ChrneP20782 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ChrneP20782 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ChrneP20782 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
ChrneP20782 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
ChrneP20782 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ChrneP20782 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ChrneP20782 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ChrneP20782 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ChrneP20782 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
ChrneP20782 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ChrneP20782 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ChrneP20782 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ChrneP20782 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ChrneP20782 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ChrneP20782 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.46
ChrneP20782 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ChrneP20782 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ChrneP20782 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
ChrneP20782 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ChrneP20782 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ChrneP20782 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ChrneP20782 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ChrneP20782 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
ChrneP20782 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ChrneP20782 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ChrneP20782 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ChrneP20782 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ChrneP20782 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
ChrneP20782 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ChrneP20782 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ChrneP20782 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ChrneP20782 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ChrneP20782 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
ChrneP20782 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ChrneP20782 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ChrneP20782 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ChrneP20782 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ChrneP20782 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
ChrneP20782 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ChrneP20782 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ChrneP20782 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ChrneP20782 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
ChrneP20782 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ChrneP20782 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ChrneP20782 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ChrneP20782 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ChrneP20782 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ChrneP20782 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
ChrneP20782 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
ChrneP20782 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ChrneP20782 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
ChrneP20782 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
ChrneP20782 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ChrneP20782 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ChrneP20782 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ChrneP20782 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ChrneP20782 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ChrneP20782 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ChrneP20782 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ChrneP20782 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.4 ms